《中国4大湖泊大鳞副泥鳅群体遗传多样性分析-论文》.pdfVIP

江苏农业学报(JiangsuJ.of Agr.Sci. ),2014,30(5):1087 ~1094 http:/ / 1087 李彩娟,凌去非,葛摇 辰,等. 中国4大湖泊大鳞副泥鳅群体遗传多样性分析[J].江苏农业学报,2014,30(5):1087鄄1094. doi:10.3969/ j.issn.1000鄄4440.2014.05.025 中国4 大湖泊大鳞副泥鳅群体遗传多样性分析 李彩娟,摇 凌去非,摇 葛摇 辰,摇 朱鹏飞,摇 王国成,摇 叶竹青,摇 韩晓飞 (苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏 苏州 215123) 摇 摇 摘要:摇 为保护大鳞副泥鳅种质资源,制定合理的野生资源保护策略,并为大鳞副泥鳅良种选育确定合适 的育种基础群体,通过第二代测序技术自主开发并合成微卫星引物400 对,经验证后随机采用其中的17 个 多态性微卫星标记对太湖、洪泽湖、洞庭湖和巢湖等4 大湖泊的野生大鳞副泥鳅群体进行遗传多样性分析。 检测到各基因座的平均观测等位基因和有效等位基因数分别为9郾5 和5郾5 个。 平均期望杂合度为0.566 5, 平均F 值为0.219 4(0郾2),N 为0.889 4(1),表明4 个大鳞副泥鳅群体间遗传交流较少,存在着较高程 st m 度的遗传分化。 4 个大鳞副泥鳅群体的等位基因数为5.4 ~6郾2(平均5郾8),观测杂合度0.273 2 ~0.386 4, 期望杂合度0.562 9 ~0.589 3,多态信息含量(PIC)为0.550 3 ~0.575 4,表明4 个群体具有丰富的遗传多样 性。 4 个大鳞副泥鳅群体间的遗传距离为0.528 3 ~ 0.967 7,洪泽湖和太湖群体间的遗传距离最小 (0.528 3),而太湖和巢湖群体间遗传距离最大,亲缘关系相对较远。 基于遗传距离的聚类结果显示4 个群 体先聚为2 个分支,其中太湖和洪泽湖群体聚为一支,洞庭湖和巢湖群体聚为另一支,这与4 个大鳞副泥鳅 野生群体的地理分布一致。 中国4 大湖泊大鳞副泥鳅自然群体具有丰富的遗传多样性,每个群体宜作为独 立的保护单元进行保护。 4 个大鳞副泥鳅群体中太湖群体和洪泽湖群体的遗传多样性最高,可作为进一步遗 传选育的基础群体。 关键词:摇 大鳞副泥鳅; 微卫星分子标记; 遗传多样性 中图分类号:摇 S966.4摇 摇 摇 文献标识码:摇 A摇 摇 摇 文章编号:摇 1000鄄4440(2014)05鄄1087鄄08 Genetic diversity ofParamisgurnusdabryanus fromfourbiglakesin China LI Cai鄄juan,摇 LING Qu鄄fei,摇 GE Chen,摇 ZHU Peng鄄fei,摇 WANG Guo鄄cheng,摇 YE Zhu鄄qing,摇 HAN Xiao鄄fei (School of BasicMedicine and Bioscience,Medical College of Soochow University,Suzhou215123,China) 摇 摇 Abstract:摇 To promote the protection of Paramisgurnus dabryanus germplasm resources, and to select the base breeding population,400 Paramisgurnus dabryanus SSRs were developed through next generation sequencing platform and400 primerpairswere synthesized. Aftervalidation,17 polymorphicEST鄄SSRmarkerswererandomly selectedoutof 400 SSR markers for genetic diversity analysis in four P. 收稿日期:2014鄄0