马氏珠母贝SRF基因的分子特征及组织特异性表达.pdfVIP

基因组学与应用生物学，2015年 ，第 34卷，第 2期，第 272—278页 GenomicsandAppliedBiology，2015，Vo1．34，No．2，272—278 研究报告 ResearchReport 马氏珠母贝SRF基因的分子特征及组织特异性表达 田荣荣 田群莉 杜晓东 焦钰 黄荣莲 王庆恒 邓岳文 广东海洋大学水产学院，湛江，524025 通讯作者．gdhddxd@hotmail．com 摘 要 血清反应因子(SRV)是一个高度保守的转录因子，在细胞增殖、细胞凋亡以及免疫反应中发挥重要作 用。为了探究血清反应因子在马氏珠母贝中的生物学功能，本研究运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆 得到马氏珠母贝SRF基因( DcDNA的全长序列，并且应用实时荧光定量PCR技术对 尸 F基因在马 氏珠母 贝不同组织中的表达进行检测。结果显示 ， F基因序列全长 l758bp，其 中开放 阅读~(K(ORF1 为 1440bp，编码 479个氨基酸，5’UTR为 65bp，3’UTR为 253bp，包含 29bp的polyA。预测其相对分子 量为 50534．6Da，理论等 电点为 7．71。多序列比对结果发现物种问SRF具有较高的保守性。SMART软件分析 显示PmSRF具有典型的MADS结构域。荧光定量PCR数据分析表明， sRF基因在马氏珠母贝闭壳肌、肝 胰腺、血细胞、外套膜、性腺、鳃六种组织中均有表达，其中在鳃中表达量最高。本研究可为进一步探究PmSRF 在贝类中的生物学功能提供重要的理论基础和参考价值。 关键词 马氏珠母贝，SRF，基因克隆，荧光定量PCR MolecularCharacterization andTissueSpecificExpression ofSRF Gene from Pinctadamartensi TianRongrong TianQunli DuXiaodong JiaoYu HuangRonglian WangQingheng DengYuewen FisheriesCollege，GuangdongOceanUniversity，Zhanjiang，524025 Correspondingauthor，gdhddxd@hotmail．COIn DOI：10．13417／j．gab．034000272 Abstract Seurmresponsefactor(SRF)isahighlyconservativetranscriptionfactor，andplaysanimportantrole incellproliferation，apoptosis，andimmuneresponse．InordertoexplorethebiologicalfunctionofSRFinPinct— adamattensii( 职 ，thefulllengthofPmSRFgenewasobtainedusingrapidamplificationofcDNAendstech— nology．Andexpressionof 5RFindifferenttissueswastestedbyreal—timePCR．Theresultsshowedthatthe totallengthofPmSRFgenewas1758bp，including1440bpoftheopenreadingflame(ORF)whichencodes479 aminoacids，a5’UTR of65bp anda3’UTR of253bpwith29bppolyA ．Thepredictedmolecularweightis 50534．6Da,andtheisoelectricpointis7．71．MultiplesequencealignmentshowedthatSRFwashighlyconservative amongspecies．ProteinsequenceanalysisshowedthatPmSRFhasatypicalMADSstructuraldomain．Inaddition、 rea1．timePCR analysisshowed nSRF couldbedetectedinalloftestedtissues，includingadductormuscle， hepatopancreas，haemocytes，mantle，gillandgonads，withthehighestexpression levelin thegil1．Ourresul