中国矮马群体mtDNA Cytb基因遗传多样性及系统进化研究.pdfVIP

中国农业科学 2013,46(3):623-629 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.03.019 中国矮马群体mtDNA Cytb 基因遗传多样性及系统进化研究 1 2 3 3 2 2 徐龙鑫 ，杨胜林 ，李爱萍 ，乜玉丽 ，杨海兵 ，戴 焰 1 2 （贵州省畜牧兽医研究所，贵阳 550005 ； 贵州大学动物科学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，贵阳 550025 ； 3 贵州省凯里畜牧兽医局，贵州凯里 560000 ） 摘要：【目的】利用线粒体细胞色素 b （mtDNA Cytb）基因为标记，从分子水平探讨中国5 个矮马 136 个样本的遗传多样性和系统进化研究，为中国矮马的开发利用以及生物多样性保护提供基础资料。【方法】 对矮马样本mtDNA Cytb 基因进行PCR 扩增和测序，运用现代生物信息学方法进行数据处理。【结果】共检 测到27 个单倍型，40 个多态位点，约占分析位点总数的3.51%。云南矮马具有最高的单倍型多样度（Hd） （0.869），最低的为四川矮马（0.740），核苷酸多样度（Pi）最高的为贵州矮马（0.00435），最低的为宁 强矮马（0.00227），各群体间的遗传多样性相差不大。系统发育树和NETwork 图中每一分支均含有5 个矮 马群体的信息。【结论】5 个矮马群体总体上具有较高的遗传多样性，其中云南、贵州及德保矮马的遗传多 样性相对较高，四川和宁强矮马相对较低；系统发生关系分析说明中国 5 个矮马群体存在基因交流，具有 多重母系起源。 关键词：中国矮马；Cytb；遗传多样性；系统进化 Genetic Diversity and Phylogenetic Relationship Among Five Pony Populations of China 1 2 3 3 2 2 XU Long-xin , YANG Sheng-lin , LI Ai-ping , NIE Yu-li , YANG Hai-bing , DAI Yan 1 2 ( Institute of Animal Husbandry and Veterinarian of Guizhou Province, Guiyang 550005 ； Key Laboratory of Animal Genetic, Breeding and Reproduction for Mountainous Areas, Ministry of Education, Animal Science College of Guizhou University, Guiyang 550025; 3Station of Animal Husbandry and Veterinarian of Kaili, Kaili 560000, Guizhou) Abstract: 【Objective 】In order to provide date and scientific basis for utilization and protection of biodiversity, diversity and phylogenetic re