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浅谈在生物信息学教学中的学科统一性 　　摘要：大学的科研与教学有着不可分离的关系。大学的科研一直在引导着教学，同时，教学也在督促着科研。科研需要通过教学把对整体的认知过程传达给学生，而教育的目的是唤起学生一种科学的统一性的意识，并借此培养一种清晰的自我意识。生物信息学是一门新兴的交叉学科，有它自身鲜明的特征。目前，如何在生物信息学教学中体现学科统一性仍然是一个未解决的课题。本文结合生物信息学的特点，初步分析了生物信息学教学与科研的关系，并探讨了如何在教学中体现出这门交叉学科的统一性。 　　Abstract: University research has a close relationship with teaching. The research leads the teaching，at the same time，the teaching also urges the research. The research conveys the whole cognitive process to students through teaching while the purpose of education is to arouse students scientific unity awareness and cultivate a kind of clear self awareness. Bioinformatics is a burgeoning cross discipline with its distinctive features. At present，it is still an unresolved issue of how to embody subject unity at bioinformatics teaching. Combining the characteristics of bioinformatics，the paper preliminarily analyzes the relation of bioinformatics teaching and research and explores how to embody this cross disciplines unity in teaching. 　　关键词：生物信息学；教学；科研；统一性 　　Key words: bioinformatics；teaching；research；unity 　　中图分类号：G42 文献标识码：A文章编号：1006-4311（2010）33-0184-01 　　 　　1以真理为业的教师 　　按照雅斯贝尔斯的说法，“大学应当成为这样的一个地方，在这里人们可以不受限制的探求真理，并在对真理的追求中培养清晰的自我意识”[1]。生物信息学像所有的学科一样，首先要传达出一种以真理为业的精神。以韦伯的《以学术为业》的著名演讲为例[2]，可知这样一种精神的传达所具有的不可替代的价值。 　　2在教学中传达生物信息学的整体性 　　2.1 生物信息学是门学科而不是工具。生物信息学最开始是为了处理基因组计划产生的大量数据而诞生的，所以总是被认为是一门工具。 　　现在的生物信息学正由过去的分析和积累生物分子的知识转变为综合多种生物分子及其相互作用的知识来了解生物系统的功能[3]。日本学者Minoru Kanehisa把生物信息学分为基因组信息学和后基因组信息学两个阶段，基因组信息学是为了处理基因组计划产生的大量数据而诞生的，它的角色是通过对生物分子的分析支持实验工作；后基因组信息学的研究可能使我们进入到对生命的基本规律的认识[3]。正是因为后基因组信息学的出现，使得生物信息学有了作为一门学科的资本。 　　2.2 生物信息学是一个整体。当把生物信息学作为一个工具时，它确实是各个不同学科的堆砌。然而，当我们的研究层次可以从单个基因和蛋白质过渡到网络，甚至全基因组的相应时，当我们注意到细胞随着时间和空间而受到动态的调控而基因也不再是静态的实体时，当我们从整个生命之树的角度处理大量信息时，生物信息就成了一个主导的整体，而不只是各个工具的堆砌[4]。它成了一门“理论”的生物学。 　　3生物信息学教师的科研能力的培养 　　从真理和求知意志的统一性上来说，科学就是哲学，是通过一种“明确而严密”的方式，体现了哲学上的冲动。教育的目的，正是要把这样一种激情和研究的方式传播给其他人。教师在讲台上的作用，不只是他说讲解和组织起来的各种知识，他的对于科学的激情和逐步探索的过程会对学生有很大的感染力。从康德到韦伯所做的经典讲座都表明，演讲者不经意间流露出的“可意会不可言传”的东西，对于讲课的效果有关键的影响。如果