用鲤鱼EST-SSRs分子标记分析长江黑龙江鲤种群结构.pdfVIP

农业生物技术学报 Journal ofAgricultural Biotechnology 2007，1 5 (6)：947-952 · 研究论文· 用鲤鱼EST—SSRs分子标记分析长江黑龙江鲤种群结构 鲁翠云·，全迎春 ，李大字·一，孙效文 ，梁利群 (1中国水产科学研究院黑龙江水产研究所，哈尔滨1 50070；2大连水产学院生命科学与技术学院，大连l 16023) 摘要：从鲤鱼(Cyprinus carpio)ESTs的数据库(10 691个)中进行微卫星序列筛选，共发现微卫星序列127个，占整个ESTs 数据库的1．19％；另外从本研究室构建的鲤鱼脑组织cDNA文库中筛选到微卫星序列20个。根据筛选得到的微卫星序列设计 引物68对，合成引物40对，其中27对引物能够获得预期的目的片段，20对引物在所检测的群体内及群体间表现出多态性。用 此20对引物标记的多态性分析了长江鲤(Cyprinus carpio)和黑龙江鲤(C carpio var haematopaerus．Temminck et Schlege1)的群 体遗传结构，结果表明：长江鲤和黑龙江鲤在多数位点表现出较高的遗传多样性，20个位点的平均有效等位基因数分别为 3．9135和3．4820；平均观察杂合度为0．6067和0．5667；平均期望杂合度为0．6737和0．6194；平均多态信息含量为0．6308和 0．5714。长江鲤的遗传结构好于黑龙江鲤，两个群体的Hardy—Weinberg偏离指数较小，群体基本保持平衡，群体结构较合理；其 中HLJEI和HLJE10位点在长江鲤和黑龙江鲤的扩增结果相差较大，长江鲤的多态性明显高于黑龙江鲤，位点多态信息含量 相差l倍以上，可用于群体的鉴别。 关键词：鲤鱼EST．SSRs；微卫星；遗传多样性 中图分类号：SI88 文献标识码：A 文章编号：l006．1304(2007)06—0947—06 Population Structure Analysis of Common Carp of Yangtze River and Heilongiiang River Using EST—SSRs Markers LU Cui．yun ，QUAN Ying-chun ，LI Da-yu 。，SUN Xiao-wen ，LIANG Li-qun rJ．Heilongiiang Fisheries Research Institute，Chinese Academy ofFishery Sciences，Harbin 1 50070,China； 2．Life Science and Technology College，Dalian Fisheries University,Dalian J 1 6023，Chin Ab呻瞅 One hundred and twenty seven microsatellite sequences were found from ESTs database(1 0 69 1 item)of common carp (Cyprinus carpio)，which occupied 1．1 9％of ESTs database．In addition，20 microsatellite sequences were isolated from constructed eDNA library for con-lmon carp，According to these microsatellite sequences，68 pairs of primers were designed with Primer Premier 5．0．Twenty seven primer pairs obtained expected product，and 20 of which showed polymorphism among populations in synthesized 40 primers．These 20 polymorphic markers were used