宁国有螺无病地区和芜湖有螺有病地区湖北钉螺基因组RF-RAPD序列分析.pdfVIP

中国人兽共 患病 学报 2Ol2，28 (4) ChineseJournalofZoonoses 351 文章编号 ：1002—2694(2012)04—0351一O7 宁国有螺无病地区和芜湖有螺有病地区 湖北钉螺基因组 RF—RAPD序列分析* 孙恩涛 。。，王 英。，张锡林。 摘 要 ：目的 比较分析不 同血吸虫病流行 区湖北钉螺基 因组 DNA 的遗传 多态性。方法 采用 RF—RAPD技术对安徽 省宁 国市有螺无病地 区和芜湖市有螺有病地 区的湖北钉螺基 因组DNA进行分析 ，进而从其扩增的多态性 图谱 中选择相近迁 移率 的RFRAPD序列进行克隆、测序，采用 DNAsis进行序列 比较和转录 因子的预测。结果 两地 区湖北钉螺基 因组 RF— RAPD谱带 中有4对相近迁移率 的条带，序列分析显示 4对 DNA 条带在序列长度和碱基组成上存在差异 ，序列相似性介于 48 ～53 之间。利用DNAsis软件在两地湖北钉螺相近迁移率的DNA条带序列发现转录因子的种类及个数均具有 明显的 差异。结论 不 同日本血吸虫病流行区湖北钉螺基 因组虽然在 RF-RAPD带型上存在一定的相似 ，但相近 RFRAPD谱带在 基 因水平上存在 明显的差异，此差异是否与湖北钉螺对 目本血吸虫的遗传 易感性相关，尚待进一步研究。 关键词 ：湖北钉螺；日本血吸虫；遗传多态性 ；RFRAPD 中图分类号 ：R383，24 文献标识码 ：A SequencealignmentofRF—RAPD bandsinOncomelaniahupensis from theregion ofNingguoandW uhu region SUN En—tao，W ANG Ying。ZHANG Xi—lin (DepartmentofParasitology，WannanMedicalCollege，Wuhu241002，China) ABSTRACT：ToanalyzethegeneticdiversityofthegenomicDNA inOncomelaniahupensisdistributedindifferentendemic areasforschistosomiasis．Thegenom icDNA extractedfrom theadultsofO．hupensisdistributedinNingguoandW uhuregion wereamplifiedbyRestricionFragmentRAPD(RF—RAPD)．Moreover，thegelpurifiedRF—RAPD bandswereisolatedandse— quenced．SequencealignmentandthemotifisoftheRAPD bandswith similarmobilitywereanalyzedwithDNAsis．Thege— nomicDNA ofO．hupensisfrom NingguoandWuhuregionweresuccessfullyamplifiedbyRF—RAPD．Sequencealignmentof fourpairsofRF—RAPD bandswith similarmobilitybetweendifferentO．hupensisshowedthateach pairofRF RAPD bands weredifferedinGC content，andtheirsimilaritieswereinthearrangefrom 48 to53 ．ItiSdemonstratedthattherearepol— ymorphism inthelength and constructionofRF—RAPD bandswhich hassimilarmobility．Inaddition，therearesignificant differencesinthetypeandnumberoftranscriptionfactorsintheRF-RAPD bandsinO．