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6酶(改)
2.国际系统命名法(国际酶学委员会1961年提出) 1.习惯命名法 根据其催化底物来命名(蛋白酶;淀粉酶) 根据所催化反应的性质来命名(水解酶;转氨酶;裂解酶等) 结合上述两个原则来命名(琥珀酸脱氢酶) 有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它特点(胃蛋白酶、胰蛋白酶、碱性磷酸脂酶和酸性磷酸脂酶)。 酶活性中心的结构特点 1.活性中心只占酶分子总体积的很小一部分(1%-2%)。 2.酶的活性中心是一个三维实体,具有三维空间结构,通常由在一级结构上并不相邻的氨基酸残基组成。 3.酶的活性中心含有特定的催化基团。对于单纯酶,活性中心就是几个AA残基或其之上的某些基团;对于结合酶,活性中心就是辅酶或其上的某一部分结构或与辅酶分子结构密切联系的蛋白质结构区。 4.酶的活性部位具有一定的柔性。 酶分子中可以作为广义酸、碱的基团 广义酸基团(质子供体) 广义碱基团(质子受体) 竞争性抑制作用的例子 竞争性抑制动力学特征 非竞争性抑制动力学特征 反竞争性抑制动力学特征 作业 教材p181页: 第1、3、4、6、11题 S + E ES E + P (1)米氏方程式(Michaelis-Menten equation)米海利斯-曼恬 k1 k2 k3 设 km= —— k2 + k3 k1 v = —————— Vmax · [S] km + [S] v = Vmax 2. 酶促反应的动力学方程式 当底物浓度很低的情况下,即[S]Km,米氏方程可转变为: 这时反应速度与底物浓度成正比,符合一级动力学; 当底物浓度很高的情况下,即[S]Km,米氏方程可转变为: 反应速度与底物浓度的关系符合零级动力学。 = k[S] (2) 米氏常数的意义 v = Vmax/2, 则: km= [S] 意义: ①km是酶的一个基本的特征常数。其大小与酶的浓度无关,而与具体的底物有关,且随着温度、pH和离子强度而改变。 ②从km可判断酶的专一性和天然底物。 Km最小的底物,通常就是该酶的最适底物,也就是天然底物。 ③当k2>>k3时, km的大小可以表示酶与底物的亲和性。 ∵ km= (k2 +k3)/k1 Km ≈ k2 / k1 S + E ES E + P ∴ km可以看作ES的解离常数ks : km= ks = ———— [S][E] [ES] 当km大,说明ES容易解离,酶与底物结合的亲和力小。 k1 k2 k3 ④km还可以推断某一代谢物在体内可能的代谢途径。 丙酮酸 乳酸 乙酰CoA 乙醛 乳酸脱氢酶(1.7×10-5) 丙酮酸脱氢酶(1.3×10-3) 丙酮酸脱羧酶(1.0×10-3) 当丙酮酸浓度较低时,代谢走哪条途径决定于km最小的酶。 ⑤Km可以帮助判断体内一个可逆反应进行的方向。如果酶对底物的Km值小于对产物的Km值,则反应有利于正反应。否则,有利于逆反应。 通常用Lineweaver-Burk作图法(双倒数作图法) —— 1 v = —— km V · —— [S] 1 + —— V 1 (y = ax + b) 斜率= km/Vmax 1/ [S] 1/v 1/Vmax -1/km (3) 米氏常数的测定 (一)抑制剂影响的作用 ——使酶的必需基团或活性部位中的基团的化学性质改变而降低酶活力甚至使酶失活的物质,称为抑制剂(I)。 1. 不可逆抑制作用:抑制剂与酶的结合(共价键)是不可逆的,不能透析法除去。 S + E ES E + P + I ↓ EI E—CH2SH +ICH2COOH →E—CH2—S—CH2COOH + HI 七、影响酶促反应速率的因素 2. 可逆抑制作用:抑制剂与酶的结合(次级键)是可逆的,能透析法除去。 抑制程度是由酶与抑制剂之间的亲和力大小、抑制剂的浓度以及底物的浓度决定。 [E] v 1 2 3 (1) 反应体系中不加I。 (2)反应体系中加入一定量的不可逆抑制剂。 (3)反应体系中加入一定量的可逆抑制剂。 [E] v 不可逆抑制剂的作用 [E] v 可逆抑制剂的作用 [I ]→ [I ] ①竞争性抑制作用:抑制剂和底物竞争与酶结合。 特点:1)抑制剂和底物竞争酶的结合部位 S + E ES E + P + I ↑↓ EI v = ——————— V[S] km(1+[I ]/ki)+[S] ki = [E][I]/[EI] [S] v V/2 km 2)抑制程度取决于I和S的浓度以及与酶结合的亲和力大小。 km ′ 无 I 有 I 3)竞争性抑制剂的结构与底物结构十分相似。 竞争性抑制剂 无抑制剂 1/Vmax 1/v 1/s 加入竞争性抑制剂后,Km 变大,酶促最大反应速度不变。 竟争性抑制通常可以通过增大底物
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