哺乳动物合成生物学中生物医药相关的回路设计策略.PDF

哺乳动物合成生物学中生物医 药相关的回路设计策略 魏伟 2013308120032 渔业 大纲 • 合成生物学简介（a simple introduction to Synthetic Biology ） • 背景及摘要（backgrounds and abstract） • 基于细胞信号通路的合成回路（Synthetic circuits based on rewired cell-signaling pathways ） • 复杂的两个或多输入回路（Sophisticated two-/multi-input design ） • 光敏合成回路（Light-responsive synthetic circuits） • 细胞间通讯工程（Engineering intercellular communication） • 修复网络（Prosthetic networks） • 总结（Conclusion ） 合成生物学简介（a simple introduction to Synthetic Biology ） 合成生物学是生物科学在二十一世纪刚刚出现 的一个分支学科，近年来合成生物物质的研究进 展很快。与传统生物学通过解剖生命体以研究其 内在构造的办法不同，合成生物学的研究方向完 全是相反的，它是从最基本的要素开始一步步建 立零部件。与基因工程把一个物种的基因延续、 改变并转移至另一物种的作法不同，合成生物学 的目的在于建立人工生物系统 （artificial biosystem ），让它们像电路一样运行。 背景及摘要（backgrounds and abstract ） 哺乳动物合成生物学以作为转录基因开关提供调控因子简 单作用开始发展，已经成为一个不断扩大的具有高度复杂功能 的基因编码回路设计工具箱。这样的哺乳动物回路设计激增， 现在可以用于DNA、RNA或蛋白质水平或某些组合的调控。回 路设计已构建了包括遗传调控开关、带通滤波器、延时回路、 存储设备、振荡器和生物计算机等设备。回路已经被设计为不 同的用途，包括执行逻辑运算、分离抗结核化合物、控制T细 胞增殖、杀死癌细胞、治疗代谢紊乱。 尽管回路设计的复杂性不断增加以及具有高度的创新性， 合成生物学的当前状态仍然是 “概念验证”。 哺乳动物合成生物学的成功，一方面是由于它能够不断改 善和创造更多先进和强大的遗传回路。另一方面是因为它能够 与其他新兴的生物学科互动，最明显的例如光遗传学。 背景及摘要（backgrounds and abstract ） 随着以合成生物学为基础的回路日益复杂化和多层化，单 一设计的细胞将不能应付编程功能的复杂性。要克服这个限制 ，需要在设计的不同细胞交流间分配一定的工程活动和代谢工 作量将它们的活动合作起来来提供协调一致的行动。 合成相互交流的多细胞组织群体，将促进组织工程、装配 复杂功能新颖的细胞模式、合成内分泌系统的进步，使越来越 复杂的基因网络的设计成为可能。 在这篇综述中，提到哺乳动物合成回路设计的新颖特点。 讨论了调节回路、回路设计上已取得的进步、光遗传学结合回 路、合成细胞间沟通和修复网络等。 基于细胞信号通路的合成回路（Synthetic circuits based on rewired cell-signaling pathways ） 为了集成内源性信号通路与合成回路，细胞被改造成响应内源性 信号转导通路的表达跨膜受体。以这种方式，这些回路使用细胞的自 然信号机制来调节细胞间功能。该系统可以设计为使用不同受体来响 应内源性或外源性刺激。 采用这一策略构建了一个用于治疗代谢综合征的合成回路，将这 个回路移植到具有代谢综合征症状的小鼠（ob/ob小鼠）体内，