3分子生物学技术课件.pptVIP

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第 五 章 第 一 节 2.退火:变性后温度快速冷却至40℃~60℃,可使引物与模板发生结合。由于模板DNA比引物复杂得多,引物与模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基的组成及其浓度,还有靶基因序列的长度。对于含20个核苷酸,G+C含量约50%的引物,选择55℃为最适退火温度的起点较为理想。引物的合适复性温度可通过以下公式帮助选择      Tm值(解链温度)=4(G+C)+2(A+T)       复性温度=Tm值-(5~10℃) 在Tm值允许范围内,选择较高的复性温度可大大减少引物与模板间的非特异性结合,提高PCR反应的特异性。复性时间一般为30~60sec,足以使引物与模板之间完全结合。 3.延伸:Taq DNA聚合酶的生物学活性:       70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子       70℃ 60核苷酸/S/酶分子       55℃ 24核苷酸/S/酶分子       高于90℃时, DNA合成几乎不能进行。 PCR反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,常用 温度为72℃,过高的延伸温度不利于引物和模板的结合。 PCR延伸反应的时间,可根据待扩增片段的长度而定,一 般1Kb以内的DNA片段,延伸时间1min足够;3~4kb的 靶序列需3~4min;扩增10Kb需延伸至15min。延伸时间过 长会导致非特异性扩增带的出现。但是对低浓度模板的扩 增,延伸时间要稍长些。 ①这类探针多克隆在质粒载体中,可以无限繁殖,取之不尽,制备方法简便。 ②DNA探针不易降解(相对RNA而言),一般能有效抑制DNA酶活性。 ③DNA探针的标记方法较成熟,有多种方法可供选择,如缺口平移法,随机引物法,PCR标记法等,都能用于同位素和非同位素标记。 一、基本原理: 反义核酸技术是指人工合成或生物合成的DNA或RNA, 能与mRNA互补,是抑制与疾病发生相关的基因表达的一种 手段,它能封闭基因表达,具有特异性且操作简单,可用 于治疗由于基因突变或过度表达所致的肿瘤和遗传疾病。 其简单的原理是:根据碱基互补配对的原则设计出能 够与靶基因特异结合RNA或DNA序列,以其影响靶基因表达 ,抑制其功能。 根据核酸种类和作用方式的不同,反义技术主要分为 反义RNA、反义DNA、核酶(ribozyme)三类,其中以反义 RNA效率最高(反义物:靶为6:l),反义DNA次(60:1) ,而核酸需1000倍于靶分子的浓度才能完全抑制mRNA的转 录和加工。 1.反义RNA的作用机制:不完全明了。 ①反义RNA与靶基因结合而被核酸酶所降解。双链RNA对核酸酶的敏感性增加,易被降解; ②反义RNA可结合于靶基因5′mRNA非编码区包括SD序列,抑制mRNA与40s小亚基结合; ③可结合于靶基因5′mRNA编码区,主要是与起始密码子AUG结合,抑制翻译起始; ④ 可结合到mRNA上,影响它从细胞核到胞浆的转运; ⑤ 影响RNA生成和降解的一套程序; ⑥作用mRNA的5′端,阻止帽子结构的形成; ⑦ 作用mRNA的polyA形成位点,阻止mRNA的成熟及转运. 作用:复制水平:反义RNA与引物结合,抑制复制。 转录水平:反义RNA与mRNA 的5′端互补结合,阻止完整RNA转录。 2.反义RNA的制备与导入细胞 反义RNA的制备包括体内和体外两种 (1)体内合成:与一般基因工程方法相同。合成cDNA (2)体外合成:体外转录法:以DNA为模板合成RNA,合成的RNA导入细胞内;化学合成法:合成仪合成后,导入细胞。方法:显微注射、脂质体介导、电穿孔法和DNA-磷酸钙沉淀法。 (二)核酶 1982年Cech发现四膜虫rRNA前体有自我剪接作用, 证明了RNA有催化作用。提出了核酶的概念。 核酶是一类独特的RNA分子,具有自我剪切和催化功 能,其特异性序列通过碱基配对识别并结合靶RNA,催化 裂解靶RNA,抑制基因表达,特别是抑制某些有害基因表 达. 1983年两位科学家Cech和Altman发现了核酶.鉴于切 赫在此领域作出的卓越贡献,因而获得1988年诺贝尔化学 奖。 人工合成具有催化活性的RNA片段(人工核酶),其 特异性序列通过碱基配对识别并结合靶RNA,催化裂解靶 RNA,抑制基因表达,特别是有害基因的表达。核酶具有 序列特异性,不编码蛋白而无免疫性,又可重复利用等优 点。 3.核酶的作用 (1)核苷酸转移作用。

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