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dna拉直方法的分析及标准的制定word格式论文
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摘要
DNA 是最为重要的遗传物质,它为生命体及生命行为提供信息代码,同时 研究发现,目前很多重大疾病的产生都很可能是由 DNA 突变导致的。因此无论 是在生物学还是临床医学上,对 DNA 单分子进行测序都是非常有必要的,但传 统的技术手段很难对单分子进行测序。近年来,随着原子力显微镜等纳米技术 的发展,再结合 DNA 拉直技术和传统的生物测序技术,实现了对单分子 DNA 的有序化测序。研究表明,对单分子进行测序,需要先将单分子拉直。故进行 DNA 拉直是整个测序过程中的第一步,也是非常关键的一步,如果 DNA 分子 无法被拉直,后面的测序实验将无法成功地进行下去。但按照目前的方法来制 备直线型的 DNA 样品,其成功率非常低,为了解决这一难题,本论文做了以下 探究:
首先根据 DNA 分子的大小,要求选择表面达到原子级平整度的物质作为拉 直 DNA 分子的基底。本实验中我们选用 APTES(3-氨基丙基三乙氧基硅烷, 3-aminopropyltriethoxysilane)溶液处理过的云母作为基底,要求 APTES-云母
(APTES 溶液修饰后的云母)表面的粗糙度不能太大,而影响其的主要因素可 能为 APTES 溶液的浓度和修饰时间。通过实验验证,我们发现在一定浓度范围 内,APTES 溶液浓度对 APTES-云母表面粗糙度的影响不大,几乎可以忽略。 同时还研究了 APTES 溶液修饰云母的时间对 APTES-云母表面粗糙度的影响, 实验表明,在一定时间范围内,修饰时间对 APTES-云母表面粗糙度的影响也不 大。根据前人的研究得知,刚刚制备的 APTES-云母表面的吸附力非常强,很难 在其上面拉直 DNA 分子。因此,我们考察了烘烤 APTES-云母的时间对 DNA 拉直效果的影响,发现在一定烘烤时间范围内,烘烤时间对 DNA 拉直效果影响 很大,烘烤时间越长,DNA 的拉直效果越好,并得出最佳的烘烤时间。
另外,拉直 DNA 的方法有很多,如自然沉积法、离心旋涂法、分子梳法等, 其中分子梳法是最为常用的方法之一。此方法操作简单,而且拉直效果较其它 方法要好一些。但此方法仍然不够完善,其拉直的成功率依然不高,并且分子 之间的方向性也很差,尤其 DNA 溶液浓度很大时,分子之间会相互交叉或重叠 形成网状的结构,此时 DNA 就很难被拉直。为了能够克服这一缺点,本文还探 讨了不同的拉直方法及 DNA 溶液的浓度对拉直的影响,通过实验证实了我们的 猜想,即:不同拉直方法对 DNA 拉直影响很大。此后,研究了不同浓度 DNA 溶液对 DNA 分子拉直的影响,研究结果表明,DNA 溶液浓度有一个合适的范 围,浓度太大或太小都会对 DNA 分子拉直产生影响。
I
摘要上
摘要
上海师范大学硕士学位论文
根据以上分析,得出了一套标准的 DNA 分子的拉直工艺,按照此标准来拉
直 DNA 分子,其重复率很高,且 DNA 分子排列的方向性非常一致。 关键词:DNA;APTES;拉直方法;DNA 浓度;标准
II
Shang
Shanghai Normal University Master of Philosophy
Abstract
Abstract
DNA is the most important genetic material, it provides genetic information for the organisms. The study found that a lot of diseases are likely to be associated with DNA mutation. Thus, it is essential for DNA sequencing in both biology and clinical medicine. However, traditional methods were difficult to DNA sequencing of single molecule. In recent years, with the development of nano technology such as atomic force microscopy, manipulation of single biomolecules and traditional Sanger Sequencing method, we achieved a novel ordered single-molecule sequencing strategy. And the preparation of linear DNA samples is the first step,
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