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洋葱花青素合成酶基因克隆和序列分析 　　摘 要:采用PCR法克隆了洋葱的花青素合成酶基因AcANS,并对其进行序列比对和生物信息学分析。结果表明,其开放阅读框为1 059 bp,编码352个氨基酸残基;具有一个富含AT的内含子,符合GT-AG规则;其蛋白质第210～309肽段含有2OG-Fe(Ⅱ) 加氧酶家族基因的结构域。 　　关键词:洋葱;花青素合成酶基因;基因克隆;序列分析 　　中图分类号:Q785文献标识号:A文章编号:1001-4942(2010)01-0001-05 　　 　　Cloning and Sequence Analysis of Anthocyanidin Synthase ??Gene in Onion 　　MIAO Jun, LIU Bing-jiang, YANG Yan-yan, HUO Yu-meng,ZHANG Yi-hui,??HUO Feng-mei,XIU Jing-run,WU Xiong??* 　　(Institute of Vegetables, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan 250100, China) 　　Abstract Bulb color is an important economic trait in onion (Allium cepa). The anthocyanidin synthase gene AcANS in onion was cloned by PCR, and its sequence alignment and bioinformatics analysis were carried out. The open reading frame(ORF) of AcANS gene was 1 059 bp, and it encoded a protein with 352 amino acids. An AT-rich intron of 107 bp, obeying the GT-AG rule, was in the DNA sequence. The 2OG-Fe (II) domain of oxygenase family gene was in the peptide from 210 to 309. 　　Key words Onion;Anthocyanidin synthase gene; Gene clone; Sequence analysis 　　 　　洋葱(Allium cepa L.)以肥大的肉质鳞茎为食用器官,根据其鳞茎的皮色可分为红皮、黄皮和白皮等品种。皮色是洋葱的重要经济性状之一,具有其自身的遗传规律[1,2]。器官的颜色是植物最重要、最直观的表型之一,对其遗传规律的研究起始于孟德尔对豌豆花色的研究,当时的研究是将基因位点与易于观察的色彩变异联系起来。如今有关花[3～5]、玉米籽粒[6～8]和拟南芥种皮[9,10]的颜色等,在遗传学、生物化学和分子生物学等方面的研究已取得重要进展。 　　花青素是决定花、叶片、果实和种子等颜色的重要因素之一,属类黄酮(flavonoids)物质。类黄酮化合物是植物的次生代谢产物,其基本碳骨架结构为C6-C3-C6,C3部分与O形成吡喃杂环。类黄酮化合物因其结构差异可被分为6 种主要类型,包括查耳酮(chalcones)、黄酮(flavones)、黄酮醇(flavonols)、黄烷双醇(flavandiols)、花色素苷(anthocyanins)和缩合单宁(condensed tannins 或proanthocyanidins)[11～13]。类黄酮广泛分布于植物界且在植物体内具有重要生理学意义,现已知它们控制着生长素的运输、根系的发育分支和向重性、种子萌发、紫外保护和抵御等[9,10,14]。?? 　　花青素由一系列酶催化合成,经由苯基丙酸类合成路径(phenylpropanoid pathway)和类黄酮生物合成途径(flavonoids biosynthetic pathway)生成[11～13]。生物合成前体为丙二酰CoA 和对香豆酰CoA,由苯基乙烯酮合成酶(CHS)催化二者形成苯基乙烯酮。黄色苯基乙烯酮异构化形成无色的黄烷酮。在黄烷酮羟基化酶(F3H)催化下形成无色的二羟基黄酮醇,由二羟基黄酮醇还原酶(DFR)催化还原形成无色花色素,无色花色素在花青素合成酶(ANS)作用下转变成有色花色素。然后由UF3GT(UDP-葡萄糖类黄酮-3-氧-葡萄糖转移酶)催化,糖基化形成比较稳定的花青素。本文克隆了洋葱的花青素合成酶基因,并对其进行序列比对和生物信息学分析,以期为进一步探索洋葱不