阿勒泰羊脂肪酸合成酶及脂蛋白酯酶基因序列分析.docVIP

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阿勒泰羊脂肪酸合成酶及脂蛋白酯酶基因序列分析

阿勒泰羊脂肪酸合成酶及脂蛋白酯酶基因序列分析   摘要:以阿勒泰羊为研究对象,对脂肪酸合成酶(FAS)基因、脂蛋白酯酶(LPL)部分编码区的cDNA进行克隆、测序,与GenBank中已收录的其他11种动物的FAS、LPL基因序列进行同源性分析,并构建分子进化树。结果显示,所克隆的FAS、LPL基因与绵羊的基因序列同源性最高,分别为99.61%、100.00%;FAS基因与虎鲸同源性最低,为46.24%;LPL基因与罗非鱼的序列同源性最低,为56.28%。结果均正确地反映了物种间的进化关系,序列分析结果为人们进一步对阿勒泰羊脂肪的相关研究、肉质性状的研究及育种提供了理论基础,同时也为阿勒泰羊FAS、LPL基因的生物学功能、遗传进化研究提供了分子依据。   关键词:硬脂酰辅酶A去饱和酶;脂肪酸合成酶;脂蛋白酯酶;序列分析;阿勒泰羊   中图分类号: S811.3;Q785文献标志码: A文章编号:1002-1302(2015)09-0043-03   新疆阿勒泰地区位于中国西北边陲,冬季长达半年,许多优良绵羊品种无法适应阿勒泰地区异常寒冷的气候条件,而阿勒泰羊以其全身肌肉丰满、体型肥硕、尾根附近沉积大量脂肪、耐粗饲、抗寒性强等特点,能够适应阿勒泰地区异常寒冷的气候条件,成为当地的优良类群[1]。脂肪酸的合成是由脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FAS)催化乙酰辅酶A和丙二酸单酰辅酶A合成甘油三脂(TAG)[2],FAS表达水平的高低能够直接影响甘油三脂在体内的沉积[3],因此FAS是脂肪酸合成代谢的关键酶。Hsu等分离得到人脂肪酸合成酶代谢调控基因,发现人的脂肪酸合成酶基因位于17q25[4]。Kameda等对鹅脂肪酸合成酶代谢调控基因作了研究,发现脂肪酸合成酶代谢调控基因全序列长度大约有 50 kb,同时现已知牛的基因位于19q22、鸡的基因位于18号染色体上[5]。脂蛋白酯酶(lipoprotein lipase,LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,是分解循环脂蛋白中乳糜微粒和极低密度脂蛋白中的甘油三酯,释放出脂肪酸和甘油的限速酶[6],作为影响脂肪沉积的一个重要遗传标记,研究LPL表达水平对加快肉品质改进速度具有重要的意义。本研究对阿勒泰羊的FAS、LPL基因部分片段进行了克隆、测序,并与已报道的其他物种的相应基因进行序列分析,以期在分子水平的基础上为家畜的改良育种提供理论依据。   1材料与方法   1.1材料与试剂   选择新疆福海县5只健康成年的阿勒泰羊,采集阿勒泰羊颈部肌间脂肪、胸部肌间脂肪、腹部肌间脂肪、腿部肌间脂肪、尾部脂肪、肝脏等6个部位的组织,立即放入液氮罐速冻,转入-80 ℃冰箱中保存。   TRIzol、DEPC、DNA marker、Taq PCR Master Mix,购自天根生物科技服务有限公司;PrimeScript@RT reagent kit反转录试剂盒(批号:RR047A),购自TaKaRa公司(批号:DRR420A);DNA凝胶回收试剂盒(批号:DP209-02)、胰蛋白胨、琼脂粉、琼脂糖、三氯甲烷、异丙醇、无水乙醇,购自北京华美生物工程公司;感受态细胞E.coli DH5α由石河子大学动物科技学院传染病实验室保存。   1.2试验方法   1.2.1目的基因引物设计以GenBank中已发布的绵羊FAS基因(登录号:NM_001009254.1)、LPL基因(登录号:NM_001009394.1 )为模版,用Primer Premier 5.0软件设计引物,由北京六合华大基因有限公司合成。FAS基因上游引物:5′-CCTCGGTGCCCGTTGTCTAC-3′;下游引物:5′-TGCTGCTCAAAGGATGTGTC-3′;目的片段长度为256 bp。LPL基因上游引物:5′-GATTAGCGATTCCTACTTCAGC-3′;下游引物:5′-AGACTTGTCATGGCATTTCAC-3′;目的片段长度为181 bp。   1.2.2RNA的提取利用TRIzol一步法提取试验样品的总RNA,琼脂糖凝胶电泳鉴定RNA的质量,于-70 ℃保存备用。然后依次加入以下试剂:1 μg RNA、10× Reaction buffer、1 μL MgCl2、1 μL DNase Ⅰ(RNase-free),用DEPC处理水补足至10 μL,除去存在的少量基因组 DNA。于37 ℃反应 30 min,然后加入1 μL 50 mol/L EDTA,65 ℃孵化10 min,即可用此RNA作为反转录模板。以RNase-free水为对照,用紫外分光光度计测定D260 nm/D280 nm值、总RNA浓度。   1.2.3反转录向提取纯化好的各组织的总RNA中加

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