香蕉一个钾离子通道基因克隆与生物信息学分析.docVIP

香蕉一个钾离子通道基因克隆与生物信息学分析 　　摘 要 从香蕉中克隆了一个钾离子通道基因MaAKT2的cDNA的ORE序列并初步分析其功能。采用PCR技术克隆该基因，利用生物信息学方法分析基因及推导蛋白的序列，利用RT-PCR技术对该基因的组织器官表达特性进行分析。结果表明，MaAKT2的cDNA ORE序列长为2 463 bp，编码821??氨基酸；MaAKT2蛋白属于植物弱内整流钾离子通道蛋白，该蛋白具6个跨膜区域，拥有CNBD、ANKY及KHA特征结构域；MaAKT2在系统发生上更接近单子叶植物弱内整流钾离子通道蛋白；MaAKT2可在香蕉根、茎、叶、花以及果实中表达，在叶中的表达量高于其它器官。MaAKT2基因的克隆为在分子水平研究香蕉钾离子吸收利用机制奠定基础。 　　关键词 香蕉 ；钾离子通道 ；基因克隆 ；生物信息学 ；表达分析 　　中图分类号 S188 　　Cloning and Expression Analysis of MaAKT2-like Gene from Banana 　　YANG Ricai JIANG Chengdong 　　（College of Horticulture and Landscape Architecture， Hainan University， Haikou， Hainan 570228） 　　Abstract The objective of this study is to clone the ORF of cDNA from a gene MaAKT2 from banana and primarily analyze its function. cDNA sequence was obtained by the approach of PCR amplification， the putative amino acid sequence were analyzed by bioinformatics software and the expression patterns in different organs was analyzed by RT- PCR. Sequence analysis indicated that the ORF of MaAKT2 gene is 2463bp in length and encodes an 861 amino acids protein. MaAKT2 protein belongs to weak inward rectifying potassium channel protein characterized with six transmembrane regions， a CNBD domain， a ANKY domain and a KHA domain. The phylogenetic analysis showed that MaAKT2 had a closer relationship with Anthurium amnicola， Ananas comosus， Oryza sativa， and Zea mays； MaAKT2 is expressed in all organs such as roots， corns， leaves， flowers and fruits with higher level in leaves than other organs. The clone of ORF of MaAKT2 is a basement for the study of the mechanical of banana potassium absorption and transport in molecular level. 　　Key words banana ； potassium channel ； gene clone ； bioinformatics ； expression analysis 　　香蕉是一种高钾作物，其正常生长发育需要消耗大量的钾肥，生产上适时提高钾肥的施用量可有效缩短香蕉的生产周期、提高产量和品质[1-2]。香蕉生产上每年要施用大量的钾肥，而我国南方香蕉栽培产区土壤普遍缺钾，加之我国钾资源缺乏，因而提高香蕉钾肥利用效率对于保证香蕉产业可持续发展具有重要意义[3-4]。探究香蕉钾吸收利用机制对于提高香蕉钾肥利用效率至为重要。而研究钾吸收利用的分子调控机制，对于改良香蕉种质具有重要意义。 　　植物钾离子的吸收和转运主要通过钾离子通道和转运体进行，克隆香蕉钾离子通道和转运体基因是研究其钾吸收利用的分子机制的基础[5]。AKT2基因