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蟾蜍转胶蛋白-2基因的克隆、生物信息学分析及其抗血清的制备-森林保护学专业论文
万方数据
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摘
摘 要
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摘要
蟾蜍基源的材料作为中药材使用具有悠久的历史,近几十年来的研究表明蟾 蜍皮肤中多肽类含量丰富,而多肽类中的抗肿瘤肽的研究正成为一个新的研究热 点,同时有报道显示这些药材具有良好的抗肿瘤效果。本文以日本蟾蜍(Bufo japonicus formosus)皮肤 cDNA 质粒文库和中华大蟾蜍(Bufo gargarizans)皮肤第一 链 cDNA 为模板,进行转胶蛋白-2 (transgelin-2, TAGLN2) cDNA 的克隆,构建其 原核表达重组质粒并诱导和纯化其重组蛋白,以及制备相应的小鼠抗血清。本论 文主要取得如下结果:
1、通过菌落 PCR(polymerase chain reaction)从日本蟾蜍皮肤 cDNA 质粒文库 获得缺失部分 5′端序列 TAGLN2 的 cDNA 克隆(GenBank 登录号为 JX197456), 长为 997 bp,包括 348 bp 的开放阅读框(open reading frame, ORF)、31 bp 的 5′端 非翻译区(untranslated region, UTR)及 618 bp 的 3′-UTR,编码由 115 个氨基酸残 基组成的 N-端截短型 TAGLN2。与其他物种的对应部分的同源性介于 71%-85%。
2、为克隆日本蟾蜍全长 TAGLN2 的编码基因,依据已克隆的 partial TAGLN2 的 cDNA 序列,设计上、下游引物 P1 和 P2,分别与自行设计的引物 XhoTT 和 日本蟾蜍皮肤 cDNA 质粒文库上游引物 SP6 组合,以上述文库为模板实施第一 轮 PCR,获得多个含有完整 5′-或 3′-UTR 的 TAGLN2 相关克隆。在此序列基础 上,再次设计引物 P3 和 P4 (分别含 5′-或 3′-UTR 末端部分序列),各自与 XhoTT 和 SP6 组合,实施第二轮 PCR。共获得 26 个克隆,其中最长序列 (GenBank 登 录号为 KC820703) 1 267 bp,包括 594 bp ORF、86 bp 5′-UTR 和 587 bp 3′-UTR。 多数克隆均有全长 ORF,编码由 197 个氨基酸残基组成的完全相同的全长 TAGLN2。但发现不同克隆间的 5′-UTR 长度有很大差别,少数克隆甚至缺失部 分 5′-端序列,与 partial TAGLN2 情况相似。此外,还发现单核苷酸多态性位点 和碱基的插入或缺失现象,显示 TAGLN2 基因多样性。同源性分析表明,与其他 物种的同源性介于 71%-78%。
3、因后续研究中需使用中华大蟾蜍开展相应工作,本论文制备其皮肤第一 链 cDNA 以及在日本蟾蜍 TAGLN2 cDNA 序列的基础上设计引物 P3 和 P4,通过 PCR 获得编码中华大蟾蜍 TAGLN2 的转录子(GenBank 登录号为 KF432856)。该
I
cDNA 长 1 207 bp,其 5′-UTR、3′-UTR 和 ORF 分别为 16 bp、597 bp 和 594 bp, 编码由 197 个氨基酸残基组成的蛋白质,与日本蟾蜍的 TAGLN2 仅有一个氨基 酸不同。 RT-PCR 组织分布检测表明 TAGLN2 在所检测的中华大蟾蜍各器官均 有表达,在肺、肝和肾中表达量较多。
4、将纯化的 TAGLN2 重组蛋白免疫小鼠,制备抗血清,并通过间接 ELISA 方法和 Western blotting 检测鼠抗蟾蜍 TAGLN2 抗血清。结果表明该抗血清效价 为 1:60 000 并具有良好特异性,符合酶联免疫检测要求。首次制备识别日本蟾 蜍 TAGLN2 的抗血清,为进一步研究 TAGLN2 的生物学功能及分析该蛋白在蟾 蜍机体中的表达奠定基础。
关键词:日本蟾蜍,中华大蟾蜍,转胶蛋白-2,重组蛋白,抗血清
II
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ABSTRACT
ABSTRACT
Bufo-origin materials have long been used in traditional Chinese medicines and many studies have indicated abundant bioactive polypeptides included in Bufo skin and their anti-tumor curative effects. The objective of the current study is to clarify the bioactive polypetides included in Bufo-origin materials by cloning cDNA
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