生物信息学现状和重要研究方向教学讲义.pptVIP

生物信息学;美国电脑执照--高薪阶层;第二讲 生物信息学现状和研究方向;主要内容;一. 什么是生物信息学？;生物信息学的发展历程;二、生物信息学及其发展;计算机运算速度: 18个月增长一倍;DNA序列数据: 14个月增长一倍;;近年来GenBank中的DNA碱基数目呈指数增加，大约每14个月增加一倍。到1999年12月其数目已达30亿，它们来自47000种生物。2000年4月DNA碱基数目是60亿。现在，2001年初这一数目已达110亿。各种生物的EST序列已达600多万条，其中人类的EST序列已超过300万条，估计覆盖人类基因90％以上；自全长1.8Mb的嗜血流感杆菌（Haemophilus influenzae Rd）基因组序列于1995年发表（Fleischmann et al.，1995）以来，已有54个模式生物的完整基因组被测序完成，它们中有9个古细菌、31个原核真细菌、14个真核生物的完整基因组或它们的完整染色体，其中包括酿酒酵母和线虫。还有另外的70余个微生物基因组正在测试当中。; 美国的核酸数据库GenBank从1979年开始建设，1982年正式运行； 欧洲分子生物学实验室的EMBL数据库也于1982年开始服务； 日本于1984年开始建立国家级的核酸数据库DDBJ，并于1987年正式服务。从那个时候以来，DNA序列的数据已经从80年代初期的百把条序列，几十万碱基上升至现在的110亿碱基！这就是说，在短短的约18年间，数据量增长了近十万倍。; Dbcat统计的生物信息数据库的数目?分类 数据库数目 分类 数据库数目DNA 87 RNA 30蛋白质 94 基因组 58基因图谱 30 蛋白质结构 18文献 43 其他 153;果蝇基因组包括1.2亿碱基对的编码区已于2000年2月测序并组装完成； 人类基因组研究的标志性工作，包含3300万碱基对的人第22号染色体已于1999年11月完成测序，结果发表在1999年12月2日的Nature 上。从第22号染色体已鉴定出679个基因，其中55％的基因是未知的。有35种疾病与该染色体突变相关，像免疫系统疾病、先天性心脏病和精神分裂症。 作为人类基因组研究的里程碑性的工作，覆盖率为90％的人完整基因组的“工作草图”已经在2000年4月底完成，到2003年将获得覆盖率为99％的人类基因组全部序列。对人的大约3万个基因。 到目前为止已定位在染色体上的基因数目有14015个(见）;How many characters are in the “Heaven Book”? 3*109 10,000 books 1 book 100 pages 1 page 3,000 characters CCGGTCTCCCCGCCCGCGCGCGAAGTAAAGGCCCAGCGCAGCCCGCGCTCCTGCCCTGGGGCCTCGTCTTTCTCCAGGAAAACGTGGACCGCTCTCCGCCGACAGTCTCTTCCACAGACCCCTGTCGCCTTCGCCCCCCGGTCTCTTCCGGTTCTGTCTTTTCGCTGGCTCGATACGAACAAGGAAGTCGCCCCCAGCGAGCCCCGGCTCCCCCAGGCAGAGGCGGCCCCGGGGGCGGAGTCAACGGCGGAGGCACGCCCTCTGTGAAAGGGCGGGGCATGCAAATTCGAAATGAAAGCCCGGGAACGCCGAAGAAGCACGGGTGTAAGATTTCCCTTTTCAAAGGCGGGAGAATAAGAAATCAGCCCGAGAGTGTAAGGGCGTCAATAGCGCTGTGGACGAGACAGAGGGAATGGGGCAAGGAGCGAGGCTGGGGCTCTCACCGCGACTTGAATGTGGATGAGAGTGGGACGGTGACGGCGGGCGCGAAGGCGAGCGCATCGCTTCTCGGCCTTTTGGCTAAGATCAAGTGTAGTATCTGTTCTTATCAGTTTAATATCTGATACGTCCTCTATCCGAGGACAATATATTAAATGGATTGATCAATCCGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGACGGTGCCATCACGCCCAGCTCATTGTTGATTCCCGCCCCCTT