丹参治疗寻常性痤疮的网络药理学研究-中药学专业论文.docx

广东药学院硕士研究生学位论文 广东药学院硕士研究生学位论文 目 录 HYPERLINK \l _bookmark0 中文摘要I HYPERLINK \l _bookmark1 ABSTRACTIV HYPERLINK \l _bookmark2 前言 1 HYPERLINK \l _bookmark3 实验部分 8 HYPERLINK \l _bookmark4 1 丹参成分 ADME 过程评价 9 HYPERLINK \l _bookmark5 1.1 ADME 理论、计算意义 9 HYPERLINK \l _bookmark6 1.2 实验方法 9 HYPERLINK \l _bookmark7 1.2.1 构建丹参成分数据库和寻常性痤疮靶点数据库 9 HYPERLINK \l _bookmark8 1.2.2 口服生物利用度预测 10 HYPERLINK \l _bookmark9 1.2.3 基于分子描述符计算的类药性预测 10 HYPERLINK \l _bookmark10 1.2.4 Caco-2 细胞模型 13 HYPERLINK \l _bookmark11 1.2.5 P-糖蛋白底物的预测 14 HYPERLINK \l _bookmark12 1.3 实验结果 14 HYPERLINK \l _bookmark13 1.3.1 丹参成分数据库和寻常性痤疮靶点数据库 14 HYPERLINK \l _bookmark14 1.3.2 口服生物利用度预测 20 HYPERLINK \l _bookmark15 1.3.3 类药性预测 21 HYPERLINK \l _bookmark16 1.3.4 Caco-2 细胞单层模型预测结果 25 HYPERLINK \l _bookmark17 2 基于分子对接的活性成分虚拟筛选 26 HYPERLINK \l _bookmark18 2.1 分子对接原理 26 HYPERLINK \l _bookmark19 2.2 实验方法 29 HYPERLINK \l _bookmark20 2.3 实验结果 31 HYPERLINK \l _bookmark21 3 构建“活性成分-靶点”相互作用网络 33 HYPERLINK \l _bookmark22 3.1“活性成分-靶点”相互作用网络意义 33 HYPERLINK \l _bookmark23 3.2 实验方法 33 HYPERLINK \l _bookmark24 3.3 实验结果 34 HYPERLINK \l _bookmark25 3.4 “活性成分-靶点”网络模型的分析及丹参作用机理的预测 36 HYPERLINK \l _bookmark26 讨论 42 HYPERLINK \l _bookmark27 结论 43 HYPERLINK \l _bookmark28 参考文献 44 HYPERLINK \l _bookmark29 综述 49 致 谢错误!未定义书签。 HYPERLINK \l _bookmark30 附录一：丹参成分化合物表 58 HYPERLINK \l _bookmark31 附录二：缩写词中英文对照表 82 附录三：在读硕士期间的科研情况错误!未定义书签。 I I 丹参治疗寻常性痤疮的网络药理学研究 中文摘要 目的：运用网络药理学方法对丹参治疗寻常性痤疮潜在的作用机制进行预测、 探究，通过吸收、分布、代谢、排泄（ADME）性质评价，采用分子对接技术筛 选丹参活性成分，构建药物分子、药物靶点、疾病三者之间的关系网络，预测、 分析丹参可能具有的治疗寻常性痤疮药理作用机制。 方法： 1 数据集建立 1．1 丹参成分数据集 从中药系统药理学数据库（TCMSP）收集丹参小分子化合物。 1．2 寻常性痤疮靶点数据集 根据寻常性痤疮的发病机制，从 Therapeutic Target Database 治疗靶标数据 库、KEGG 京都基因与基因组百科全书等数据库中挖掘痤疮治疗靶标。 2 ADME 过程评价 通过对丹参分子的分子描述符的计算，根据 Lipinski 五规则、Veber 口服生 物利用度大小规则从化学空间的角度分析丹参分子的类药性。根据定量构象关系 原则，通过口服生物利用度预测模型、Caco-2 细胞模型、P-糖蛋白（P-gp)底物 预测对丹参分子的部分 ADME 进行预测。 3 丹参活性成分筛选 基于分子对接技术的虚拟筛选，将丹参分子与寻常性痤疮靶点蛋白晶体，运 用 Auotodock 进行分子对接，以原配体与受体的对接分数为阈值，丹参小分子与 相关靶标对接分数绝对值高于阈值绝对值