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肺炎支原体Ohr样蛋白的结构及功能的初步研究-病原生物学专业论文
PAGE
PAGE 10
缩略语
主要中英文缩写
全 称
中 文 名 称
氨基酸
AA/aa
Amino acid
A560
absorbance at 560 nm
560nm 处吸光度
A310
bp
absorbance at 310 nm
Base pair
310nm 处吸光度
碱基对
BSA
Albumin Bovine Serum
牛血清白蛋白
DNA
deoxyribonucleic acid
脱氧核糖核酸
dNTP
Deoxyn deoside triphosphate
脱氧三磷酸核苷酸
DTT
Dithioth eitol
二硫苏糖醇
EB
Ethidium bromide
溴化锭
ECL
Enhanced chemiluminescence
增强化学发光
EDTA
Ethylene diamietetraacetic acid
乙二胺四乙酸
FOX
Ferrous Oxidation-Xylenol Orange
氧化铁二甲酚橙
GSH
Reduced glutathione
还原型谷胱苷肽
GSSG
Oxidized Glutathione
氧化型谷胱甘肽
IPTG
LB
Isoprop-β-D-thiogalactopyranoside
LB medium
异丙基-β-D-硫代半乳糖
LB 培养基
Mp
Mycoplasma pneumoniae
肺炎支原体
NC
Nitrocellulose
硝酸纤维素膜
OD
Optical density
光密度
OHP
Organic Hydroperoxide
有机氢过氧化物
Ohr
Organic Hydroperoxide Resistance Protein
有机氢过氧化物抗性样
ORF
Open reading frame
开放阅读框
OX
xylenol orange
二甲酚橙
PAGE
polyacrylamide gelelectrophoresis
聚丙烯酰胺凝胶电泳
PBS
Phosophate buffered saline
磷酸盐缓冲液
rMPN668
Recombinant MPN668
重组 MPN668 蛋白
rpm
Revolutions per minute
每分钟转数
RT-PCR
Real-time Polymerase chain reaction
实时聚合酶链式反应
SDS
Sodium Dodecyl Sulphate
十二烷基硫酸钠
SDS
SDS-polyacrylamide gel eletrophroresis
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
t-BHP
tert-butyl hydroperoxide
叔丁基过氧化氢
TBS
Tris-buffered Saline
Tris 缓冲盐溶液
TBST
Tween20/ Tris-buffered Saline
吐温 20/Tris 缓冲盐溶液
TEMED
N,N, N′N′-tetramethylethylenediamine
N,N,N′N′-四甲基乙胺
Tris
Tris-(Hydroxymethyl) aminomethane
三羟甲基氨基甲烷
肺炎支原体 Ohr 样蛋白结构及功能的
初步研究
硕士研究生: 陈列松
导 师: 吴移谋 教授
中 文 摘 要
目的: 研究肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,Mp)重组 MPN668 蛋白 是否具有降解有机氢过氧化物(Organic Hydroperoxide,OHP)的能力,并通过 分子模拟解析 rMPN668 的结构,初步分析其结构与酶活性的关系,以进一步了 解 Mp 的致病机制。
方法:以 Mp129 株基因组 DNA 为模板,PCR 法扩增目的基因 mpn668,将其 亚克隆至 pGEX-6P-1 载体中。经鉴定后将其转化至表达菌 E.coli BL21 中进行诱 导表达。采用 SDS和 Western blotting 等方法对表达产物进行分析鉴定并 纯化 GST 融合蛋白;切除重组蛋白 GST 标签后,采用氧化铁二甲酚橙(Ferrous Oxidation-Xylenol Orange ,FOX)实验检测其氢过氧化物酶活性。固体培养 Mp, 随后将其置于氧化应激条件下培养 3~5d,RT-PCR 检测 mpn668 mRNA 的表达水 平。利用同源建模和分子动力学等方法,通过软件 Expasy 与 HYPERLINK /Research/vmd/ Visual Molecular HYPERLINK /Research/vmd/ Dynamics(VMD)模拟 rMPN668 的分子结构,并对其已预测出的酶活性位点的 氨基酸进行定点突变,通过诱导表达获得△rMPN668
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