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食管鳞癌染色体畸变研究及候选扩增癌基因的鉴定遗传学专业论文
中困医学科学院北京叭和医学院
中困医学科学院北京叭和医学院 博I:研究生学位论义
缩略语表
英文缩写 英文全称 中文全称
BAC bacterial artificial chromosome 细菌人工染色体 CCD cooled charge—coupled device camera 冷电荷藕合设备相机 CGH comparative genomic hybridization 比较基因组杂交
CNV copy number variation 拷贝数目变异
DAPI 4,6··diamidino··2·,phenylindole 4,6.二氨基.2.苯吲哚
DOP·-PCR degenerate oligonucleotide··primed 简并寡核苷酸引物聚合
polymerase chain reaction 酶链反应 ESCC esophageal squamous cell carcinoma 食管鳞癌 FISH fluorescence/n situ hybridization 荧光原位杂交
FITC fluorescein isothiacyanate 异硫氰酸荧光素
IHC immunohistochemistry 免疫组织化学
LOH loss of heterozygosity 杂合性丢失 M—FISH multicolour fluorescence/n situ hybridization 多色荧光原位杂交 NSCLC Non-Small Cell Lung Cancer 非小细胞性肺癌 RDA representational difference analysis 代表性差异分析
RLGS restriction landmark genome scanning 限制性标记基因组筛选
RNA i RNA interference RNA干扰
Rx··FISH cross--species color banding 交叉物种多色显带
SKY spectral karyotyping 光谱核型分析
TMA tissue microarray 组织微阵列
WCP whole chromosome painting 全染色体涂染探针
论文独创性声明本论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成
论文独创性声明
本论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成 果。论文中除了特别加以标注和致谢的地方外,不包含其他人或其它 机构已经发表或撰写过的研究成果。其他同志对本研究的启发和所做 的贡献均已在论文中作了明确的声明并表示了谢意。
论文使用授权声明
本人完全了解北京协和医学院有关保留、使用学位论文的规定, 即:学校有权保留送交论文的复印件,允许论文被查阅和借阅:学校 可以公布论文的全部或部分内容,可以采用影印、缩印或其它复制手 段保存论文,保密的论文在解密后遵守此规定。
作者签名:在咝 导师: 期:?箩多:!:9
食管笪聋痛染乜仆畸变研究及攸选扩增痛堆l大I的举定食管鳞癌染色体畸变研究及
食管笪聋痛染乜仆畸变研究及攸选扩增痛堆l大I的举定
食管鳞癌染色体畸变研究及 候选扩增癌基因的鉴定
摘 要
食管癌的死亡率在我国恶性肿瘤中居第四位,鳞状细胞癌是我国食管癌的主 要病理类型,总体五年生存率仅约10%。为鉴定与食管癌关系密切的基因,本研 究从染色体畸变的角度出发,在实验室前期工作及相关文献的基础上,统计分析 食管癌染色体畸变谱,发现3、5、8号染色体重排及着丝粒断裂再重组可能是最 常见的结构改变,3q、8q增益是最常见的数目异常。
本研究首先选择食管癌中结构改变较多、扩增频率最高的染色体区段3q进 行分析。依据本课题组前期对27例标本3q24.q29(跨越75Mb)的28个位点的 扩增频率分析,我们绘制了3q26.q27区段23个位点扩增频率改变的趋势图。鉴 定了3q26.2、3q26.31及3q26.33三个扩增子,在扩增子内挑选了MDSl,PRKCI, ECT2和PIK3CA四个候选基因进一步分析。
双色荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测108例食管
鳞癌发现MDSl,PRKCI,ECT2和鹏C么的扩增率分别是53.5%、53。4%、40。O%
和32.3%, MDSl和PR魁一,在食管癌组织及细胞系中均存在共扩增的现象,但 只有PRKCI基因的扩增与浸润深度俨0.043)、淋巴结转移(P=0。015)及病理分 期(胆O.002)相关。
定位于3q26.2上的PRKCI(也称为PKCt)基因编码的蛋白是一种不典型的 丝氨酸/苏氨酸激酶,目前对其在具体肿瘤中作用的研究还相对较少,为此我们 对该基因在食管癌中的作用进行
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