鹳形目、雁行目和孔雀属的分子系统发生研究-动物学专业论文.docxVIP

鹳形目、 鹳形目、 gl Sn孑L雀属的分子系统发生研究 专业：动物学 硕=}=生：王蔚 指导老师：常弘教授 摘 要 鹳形目鸟类和雁形目鸟类的传统分类一直存在分歧，而近期的分子系统学 研究大多只用单个基因，其结论的可信度需要进一步验证。对于鹳形目，本研究 通过核c—mos基因和线粒体12S rRNA基因序列分别和合并分析，采用分子系统学 方法探讨了鹳形目6科12种鸟类的系统发生关系。文中测出鹳形目6种鸟类核 c—mos基因的片断序列，结合来自Genebank的其他种类的c—mos和12S rRNA基 因序列，分别经Clustal w软件对位排列后，以原鸡为外类群根据单基因和合并 序列分别用最大似然法、最大简约法邻接法和和贝叶斯法建立系统树。系统树分 析表明，鹳形目6科之间的系统发生关系总结为：(鹭科，((鸦科，美洲鹫科)， (鹳科， (鲸头鹳科，锤头鹳科))))。盟科7个属之间的系统发生关系总结 为：(麻璃属(夜鹭属(池鹭属(苍鹭属(中白鹭属(白鹭属，大白鹭属))))))。 对于雁形日，本研究通过核c—mos基因和线粒体12S rRNA基因序列分别和合并 分析及cytb基因序列分析，采用分子系统学方法探讨了雁形目3科17种鸟类的 系统发生关系。本研究测出雁形目9种鸟类核c—mos基因的片断序列，结合来自 Genebank的其他种类的c—mos、12S rRNA和cytb基因序列，经Clustal W软件 对位排列后，以原鸡为外类群根据单基因和合并序列分别用最大似然法、最大简 约法邻接法和和贝叶斯法建立系统树。通过各系统树的比较总结，雁形目各科间 的关系为：(雉科(叫鸭科(雁鸭科，鸭科)))；鸭科中各属间的关系为：(树鸭 属(雁属(潜鸭属(鸳鸯属，鸭属))))；鸭属中各种间的关系为：((花脸鸭，琵 嘴鸭)，((绿翅鸭(绿头鸭，斑嘴鸭))，((针尾鸭(罗纹鸭，赤颈鸭))))。 本研究中基于不同单个基因的系统树都存在一定差异，表明基于单一基因 的系统树是有一定误差的，需要通过序列合并分析或相互比较来进一步提高准确 性。而基于合并数据的系统树支持率和分辨率都明显高于基于单基囡的系统树， 表明使用在遗传上相对独立的分子数据合并建立系统树有较高的可信度和分辨 率，是一种更可靠的分子系统学研究方法。 率，是一种更可靠的分子系统学研究方法。 孔雀属内已有一些针对某一亚种或种群的微卫星和RAPD方法研究，然而国 内外尚未有报道基于DNA序列分析的针对整个孑L雀属的分子系统学研究。本研究 测定了中国分布的野生绿孔雀和人工驯养的蓝孑L雀、杂色孔雀、杂交孔雀以及自 孔雀共5个种或亚种或变种的个体的线粒体细胞色素b基因的长为1140bp的全 序列。研究了其碱基组成及变异情况。结合GeneBank中真绿孔雀亚种、非洲孔 雀、原鸡以及鹑的线粒体细胞色素b(cytb)全序列，经Clustal w软件对位排 列后，以原鸡、鹑和非洲孔雀为复合外类群根据单基因和合并序列分别用最大似 然法、最大简约法邻接法和和贝叶斯法建立系统发生树。通过各系统树的比较总 结，将孔雀属的6种(或亚种、变种)鸟类的系统发生关系总结如下：((帝王孔 雀，真绿孔雀)，((蓝孔雀，杂交孑L雀)，(白孔雀，杂色孔雀)))。 关键词：鹳形耳、雁形耳、孔雀属、分子系统发生 Molecular Molecular Phylogenies of Ciconiifomes，Anseriformes andPavo Major：Zoology Name：W^NG Wei Supervisor：Professer CHANG Hong ABSTRACT The evolutionary history of Ciconiiformes and Anseriformes still remained controversy．Morphological，ecological studies had not draw consensus conclusion· And recent phylogenetic studies were mostly based on single gene．It is necessary to have some studies based on combined gene sequences．In present studay，we tried t0 assess phylogeny among 12 species of Ciconiifomes based on analysis of the nuclear c．mos gene and mitochondrial 12S rRNA gene sequences．C—mos gene partial sequen