利用ImageJ图像研究软件改进乙酸纤维素薄膜电泳教学实验.docxVIP

利用ImageJ图像研究软件改进乙酸纤维素薄膜电泳教学实验.docx

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利用Image J图像研究软件改进乙酸纤维素 薄膜电泳教学实验 【摘要】乙酸纤维素薄膜电泳(CAME)是重要的实 验技术,是生物化学、生物化学检验等课程的基本教学实验, 针对以往条带法测定各蛋白条带百分含量的不足,笔者利用 Image J图像分析软件改进CAME教学实验中的蛋白条带百分 含量结果分析,提高了学生的图像处理能力,使教学实验更 加贴近临床应用,有效地提高了教学中学生的积极性和教学 质量。 【关键词】Image J;图像分析;乙酸纤维素薄膜电泳; 教学;实验 1常规乙酸纤维素薄膜电泳中存在的问题 乙酸纤维素薄膜电泳(CAME)由于其微量、快速、简便、 分辨力高等优点,目前已成为高校生物化学、生物化学检验 等课程实验教学的常规项目之一,并在临床中被广泛应用于 血清蛋白、糖蛋白等生物大分子的临床分离与检测[lloCAME 的基本原理是利用蛋白质在缓冲液中所带电荷的不同,而电 泳迁移率不同,从而将不同类型的蛋白分离开。通过CAME 电泳后,血清中的蛋白质被分离为5个条带,临床中常需要 了解各类蛋白的百分含量以对血浆蛋白质的情况做出评估, 需要对各条带中的蛋白质进行定量。相对定量的方法主要有 洗脱法和光密度扫描法。光密度扫描法需要专门的光密度扫 描装置及图像处理软件,许多高校并不具备这样的条件而无 法开展。多数高校是采取的洗脱法,即将各条带剪下后,浸 泡入洗脱液,将各条带上的蛋白洗脱下来,然后通过比色测 定其相对含量以计算各类蛋白的百分含量。但这种方法虽然 对仪器设备的要求较低,但由于其需要剪条带、洗脱、比色 多个手工步骤才能完成,人为操作误差较大,且结果仅可以 获得各类蛋白的百分含量数据而无法得到类似于临床自动 化电泳仪的峰形含量图结果,不利于学生将所学知识与临床 应用相结合。 2 Image J图像分析软件 随着信息技术在临床检验中的应用与发展,计算机处理 图像使实验结果更加精密、准确o Image J软件是一个用Java 语言开发的图像处理和分析平台,具备各种图像处理和分析 功能。Image J 是由 National Institutes of Health 开发 的共享的医学图形分析软件。可运行于Microsoft Windows、 Mac OS、Mac OS X、Linux 和 Sharp Zaurus PDA 等多种平台。 Image J能够显示、编辑、分析、处理、保存、打印8位、 16 位、32 位的图片,支持 TIFF、PNG、GIF、JPEG、BMP、DICOM、 FITS等多种格式。Image J支持图像栈功能,即在一个窗口 里以多线程的形式层叠多个图像,并行处理。只要内存允许, Image J能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操 作,比如缩放、旋转、扭曲、平滑处理外,Image J还能进 行图片的区域和像素统计,间距、角度计算,能创建柱状图 和剖面图,进行傅里叶变换[2]。电泳条带图像一般可以通 过数码相机、扫描仪和USB摄像头等摄像设备进行获取。由 于高像素智能手机和数码相机在大学生中的普及,电泳图像 的获取变得容易。利用高像素手机或数码相机,学生可以获 得CAME电泳后的薄膜图像,从而应用Image J图像分析软 件进行分析。通过利用Image J图像分析软件改进CAME教 学实验中的蛋白质百分含量测定有利于提高学生的信息处 理能力,使教学实践与临床实际应用相结合,而且学生通过 亲自操作Image J图像分析软件进行图像分析,学习参与性 和积极性大大提高。 3 Image J图像分析软件分析乙酸纤维素薄膜电泳图谱 的教学应用 3. 1 CAME实验和图像的获取 按照CAME实验方法操作获得分离开的血清蛋白质电泳 条带后,把乙酸纤维素薄膜放在白色滤纸上,使用高像素手 机或数码相机拍照采集图谱,像素高于500万可以获得较为 满意的图片。 3. 2 Image J软件安装 将Image J软件安装安装在电脑上‘Windows、Linux、 Mac OS等平台上均可运。需要注意的是Image J的运行需要 JAVA运行环境的支持。 3.3图像结果分析 3. 3. 1图像黑白化 启动Image J,打开采集的图像后,按下列步骤进行菜 单操作:编辑(Edit) -*颠倒(Invert) f图像(Image) -*类型(Type) -*8-bit,然后点击分析(Analyze) 校准 (Calibrate) f (Uncalibrate OD)并选择OK按钮之 后会出现校正的图形。 3. 3.2选定条带区域 打开工具栏,用方形图像选择工具在图像上圈定一个电 泳图谱(注意要将各个条带都全部框住),然后菜单操作: Analyze—Gelsf Select F让st Lane (快捷键为 Ctrl+1),

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