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广州地区人巨细胞病毒临床低传代株 UL141基因的序列特征
谭琪琪王波胡兢晶苏海浩伍苑宾郭梦杰 广州医科大学附属广东省妇儿医院/广东省妇幼保健 院儿科
摘要：
目的UL141基因的结构特征及多态性对发现人巨细胞病毒(HCMV)感染致病性 机制具有指导意义。文中旨在研究广州地区HCMV临床低传代株UL141基因的序 列特征。方法 选取2016年3月至2017年3月在广州医科大学附属广东省妇儿 医院儿科就诊的10例I1CMV患儿，收集患儿尿液标本，从中分离低传代临床病毒 株，应用多重PCR方法鉴定，对其进行HCMV UL141基因全序列扩增、克隆、鉴 定、测序，并在Gen Bank搜索HCMV UL141同源序列,行序列分析。结果UL141 基因存在UL141a及UL141b2处开放阅读框架(0RF),分别由315及1017个核 昔酸构成，Gen Bank登记号分别为DQ180372和DQ180371。UL141基因全长1277 bp,编码蛋白由338个氨基酸残基组成，UL141a及UL141b开放阅读框架0RF分 别为315、1017 bp,其DNA序列比较保守，存在46处位点变异，变异皆为碱基 替换，无插入或缺失。HCMV UL141编码蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均 比较保守，所有分离株UL141蛋白的等电点均在8. 368. 68之间。结论广州地区 HCMV临床低传代分离株UL141基因及其编码的氨基酸序列比较保守，但仍存在 一定的多态性，为进一步揭示UL141蛋白的功能及IICMV感染的致病机制奠定了 基础。
关键词：
人巨细胞病毒;生物信息学;UL141;基因序列;多态性;
作者简介：王波，E-mail : dr. wangbo@163. com
收稿日期：2017-06-01 基金：国家自然科学基金
Characterization of the sequences of human cytomegalovirus UL141 in
low-passage clinical isolates in Guangzhou
TAN Qi-qi WANG Bo HU Jing-jing SU Hai-hao WU
Yuan-bin GUO Meng-jie
Department of Pediatrie, Guangdong Women and
Ch订drens Hospital, Guangzhou Medical
University;
Abstract：
Objective The sequence characteristics and polymorphism of the UL141 gene may help find the pathogenesis of human cytomegalovirus ( HCMV) infection. This study was to characterize the sequences of HCMV UL141 in low-passage cl inical isolates in Guang/hou. Methods We collected urine samples from 10 inf ants with clin ically conf inned 11CMV infection in the Guangzhou areei, isolated low-passage clinical virus strains and identified them by multiplex PCR. We performed amplification, cloning, identification and sequencing of the HCMV UL141 gene and searched the Gen Bank for its homologous sequences fol lowed by sequence analysis. Resul ts The HCMV UL141 gene was found to have 2 open reading frames ( ORF) , UL141 a and UL141 b, composed of 315 and 1 017 nueleotides and included in the Gen Bank with the sequence numbers of DQ180372 and DQ180371, respectively. The full length of the UL141 gene in the low-passage HCMV clinical stra
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