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用实例演示PHYLIP软件构建进化树 生科12第五组;一.用Clustal W 进行序列对比。
1.登录网页www.ebi.ac.uk
;2.单击网页下面的Bioinformatics services
;3.单击DNARNA，找到“ClustalW2”
;4.按一定的格式输入序列号
如输入：;5.单击Submit，屏幕会出现结果
;二.采用UPGMA法和邻接法构建进化树，用PHYLIP软件中dnadist等软件。;2.在Enter your data below中输入对比序列的结果。
;3.单击Run.出现结果;4. 在“resluts”页面下选择“neighbor”, 点击“further analysis”，后“Run”出现下图：;5.得到一个结果得粗略图和画图参数，将图??得到的画图参数“(d4:0.20944,(d1:0.20944,d2:0.20944):0.90440,d3:0.20944);” 存到文本文档（“.txt”）,存入电脑。; ;2.在Enter your data below:中输入1）中的结果，单击“Run”得到一个结果得粗略图和画图参数，将图中得到的画图参数“((d2:0.16667,d1:0.16667):0.66667,d4:0.16667,d3:0.16667);“
存到文本文档（“.txt”）,存入电脑。
;四.用最大似然法构建进化树，用PHYLIP软件中dnadist等软件。;2.在Enter your data below:中输入1）中的结果，单击“Run”
;3.在“resluts”页面下选择“consense”, 点击“further analysis”，后“Run”出现下图：
;4.得到一个结果得粗略图和画图参数，将图中得到的画图参数“(((d2:1.0,d1:1.0):1.0,d3:1.0):1.0,d4:1.0);
”存到文本文档（“.txt”）,存入电脑。;五.用Tree View软件画图;谢谢观赏
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