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如何发现药物新靶标
文献综述
摘要:药物靶标的发现是创造新药物的前提,也是药物筛选的基础,本文从有
效单体化合物、基因表达差异、蛋白质表达差异、蛋白质相互作用和 RNA 干扰
方面着手总结了一些药物新靶标的发现技术进行了综述。
关键词:药物靶标;基因表达差异;差异蛋白质组学;蛋白质相互作用;RNA
干扰
引言:药物靶标是药物作用而实现疗效的目标分子,靶标的发现是药物创新的
前提,也是药物筛选的基础。新靶标的发现对于更优良的创新型药物的开发具有
重大的促进作用。例如,利用 HMG CoA 还原酶作为药物靶标开发了一系列他汀
类降脂药物,仅 2000 年,该类药物的销售额达 120 亿美元,并以每年 15%~20%的
速度增长。Novartis 公司利用慢性粒细胞性白血病(CML)相关蛋白 Bcr-Abl 为靶标,
在短时间内开发出有效治疗 CML 的新药—高活性 Bcr-Abl 激酶抑制剂
【1】
STI571(Gleevac) 。 从这些例子可以发现,生物医药公司花费大量的物力和财
力寻找药物的新靶标。随着生命科学的发展,各种科技的创新,也出现了很多药
物靶标的发现技术。
一、从有效单体化合物着手发现药物靶标
以疗效确定的单体化合物(天然产物或现有药物)为探针,然后利用计算机模
拟单体分子与相关蛋白质三维结构及其相互作用,找到所有的能与其特定结合的
蛋白质,这些蛋白质可能与活性药物单体发挥作用的机制相关,因此是潜在的药
物靶标分子。蒋华良等便是用此方法发现了 2 个抗幽门螺旋杆菌活性的药物的作
用靶标蛋白 def 和 TyX ,并测定了 def 蛋白复合物的晶体结构。张永清【2 】等利用
基因芯片研究苦参碱诱导白血病 K562 细胞基因表达谱改变,发现CCNB1,cyclinD1 ,
PCNA 等基因表达发生明显改变,这些基因可能是苦参碱作用靶点之一。Chen
【3 】等也利用这个方法研究阿霉素处理 MCF-7 细胞后蛋白质表达的改变,发现阿
霉素造成 MCF-7 细胞中热休克蛋白 27(Hsp27)的 3 个异形体表达显著下降,由此
推测 Hsp27 可能是控制乳腺癌生长的一个潜在药物靶标。
二、以正常组织与病理组织基因表达差异发现靶标
基因在不同组织和疾病发生发展的不同时空存在着明显的基因表达差异,表达
明显发生变化的基因常与发病过程及药物作用途径密切相关,这些表达异常的基
【4 】
因很有可能是药物作用的靶点,可作为潜在的筛选药物的靶标 。基因芯片技
术、mRNA 差异显示技术、抑制性消减杂交技术和基因表达系列性分析技术等在
现代生命科学研究中使用也日益广泛,这些技术在新的药物靶标的发现中同样扮
演了重要的角色。
【5 】
Heller 等利用基因芯片技术分析了正常及诱发病变的巨噬细胞、软骨细胞系、
原代软骨细胞和滑膜细胞的 mRNA,发现了数种变化明显的基因,其中包括基质
金属弹性蛋白酶基因,为治疗类风湿关节炎提供了新的药物靶标。Kapp 【6 】等利
用该技术分析了霍奇金病细胞系中 950 个基因的表达情况,并与 EB 病毒永生化
的 B 淋巴细胞系 LCL-GK 的基因表达谱相比较,发现白细胞介素-13 及其信号转导
通路可能成为治疗 HD 新的药物靶标。
Yamamoto 【7 】等通过基因表达系列性分析技术分析 Hela 细胞中基因的表达模
式,发现了许多高表达的基因,同时也发现了许多新的肿瘤特异性基因,这为肿
【8 】
瘤的治疗提供了新的靶标。Ryo 等利用该技术研究 HIV-1 病毒感染人 T 细胞株
MOLT-4 后基因表达模式变化,发现了 53 个发生显著表达变化的基因,这为艾滋
病的研究提供了重要的线索。
Fisher 【9 】等将 mRNA 差异显示技术用于乳腺癌细胞与正常乳腺上皮细胞的对
比研究中,发现周期蛋白 D2 在癌细胞中表达下降,并且进一步实验,结果暗示
【10】
了周期蛋白 D2 基因可能是 5-氮杂胞苷治疗
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