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蛋白质组学数据分析
功能分析
报告人: 张扬
QQ:
复旦大学
原始数据预处理
同位素峰去除
噪声去除
质量数校正
修饰肽段 肽段检索
甲基化 修饰位点 非标记定量值计算 蛋白组装
乙酰化 丰度 相对表达量比值校正 分子标志物模型建立
磷酸化
修饰 定量 定性
泛素化
糖基化
Replication
Transcription Translation
DNA RNA Protein
Reverse Transcription
基因组 转录组 蛋白组
样本重复检测的变异度
序列拼接 原始数据校正 原始数据获取
基因及基因结构预测 差异基因筛选 定性 原始数据可靠性
序列分析 分子标志物模型建立 定量 GO功能分析
物种之间比较 基因表达量分类 通路分析
进化分析 网络分析
…… ……
概要
• 网上注释信息获取
• 蛋白序列预测
• 实验重复性评估
• 差异基因筛选
• 基因预测模型
• 基因分类
• GO 分析
• 通路分析
• 网络分析
• 染色体定位
高维数据
基因水平上的高度注释库
NCBI Entrez Gene
/gene
涵盖基因结构、转录产物、分子功能、
蛋白蛋白相互作用、生物通路、组织表
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