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基因编辑技术
III
This manuscript was revised by JIEK MA on December 15th, 2012.
现代科技作业
姓名:马涛涛 专业:计算机系(一班)
基因编辑技术
一简介
基因编辑技术指能够让人类对日标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等. 利用该技术,可以精确地定位到基因组的某一位点上,在这位点上剪断靶标DNA片段并插入新的 基因片段。此过程既模拟了基因的自然突变,又修改并编辑了原有的基因组,权正达成了 “编雅 基因。
现代基因组编辑技术的基本原理是相同的.即借助特异性DNA双链断裂(DNA double-srrand breaks DSB s)激活细胞天然的修負机制,包括非同源末端连接(NHEJ)和同源重组修复(HDR)两条 途径。
非同源末端连接(NHEJ)是一种低保真度的修复过程,断裂的DNA修复重连的过程中会发生 碱基随机的插入或丢失,造成移码突变使基因失活,实现目的基因敲除。如果一个外源性供体基因序 列存在,NHEJ机制会将其连入双链断裂DSB位点,从而实现定点的基因敲入。
定点大右段JB騰同源重组修其(HR)是--种相对髙保貞?度的修复过程.在一个帯有同源臂的重组供体存在的情 况下,供体中的外源目的基因会通过同源重组过程完整的整合到靶位点,不会岀现随机的碱基插入 或丢失。如果在一个基因两侧同时产生DSB,在一个同源供体存在的情况卜L可以进行原基因的替 换。
定点大右段JB騰
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定点k段替换
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图1基因组编辑原理示意图
基因编辑技术的种类
目前主要有3种基因编辑技术,分别为:
人工核酸酸介导的锌指核酸(zinc- finger nucleases. ZFN)技术;
转录激活因子样效应物核酸(transcription activator- like effector nucleases. TAKEN)技术;
RNA 引导的 CRISPR- Cas 核酸酶技术(CRISPR- Cas RGNs) o
表1不同基因组编辑技术比较
ZFN
TALEN
CRISPR
识别模式
蛋白质.DNA
蛋白质?DNA
RNA.DNA
识别长度
(3-6) x 3 x 2 hp
(12-20) x 2 bp
20 hp
识别序列特点
以3 hp为单位
5前一位为T
3’序列为NGG
特异性
较高
一般
一般
构建难易
难度大
较容易
容易
细胞毒性
大
较小
较小
四基因编辑技术的应用前景
基因功能研究
基因敲除是在活体动物上验证基因功能必不可少的逻辑环节,但是传统的基因敲除方法需要通 过复杂的打靶载体构建、ES细胞筛选、帙合体动物模型选育等一系列步骤.成功率受到多方而 因素的限制。
即使对于技术比较成熟的实验室.利用传统技术敲除大鼠或小鼠身上的某个基因一般也需要1 年以上。基因编辑新技术则不然,敲除基因高效快速,是研充基因功能的有力工具。
ZFN技术己在大鼠、小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥、玉米、烟草等模式生物或经济物种的细胞 或胚胎中以及包括诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells. iPSC)在内的人体外培养细 胞系中成功地实现了内源基因的定点突变,其中在果蝇、斑马鱼、大鼠等物种中还获得了可以稳定 遗传的突变体。
2009年,威斯康诉医学院、Sangamo Biosciences、Sigma- Aldrich等多家机构使用ZFN 技术,成功培有岀首只靶基因敲除的大鼠,而且带有该突变的大鼠所生育的后代同样带有该基因突 变。
基因治疗
传统的基因治疗是将正常的基因片段引入细胞中替代有缺陷的基因,但这种方法难以精准控 制,可能产生很大的毒副作用。基因编辑新技术可以精确定位,在靶位点进行修正或进行基因切 除,达到基因治疗的目的.
Bacman等人利用TALEN技术清除了来自于病人线粒体内的有病DNA,这是TALEN首次应用于 线粒体基因的编辑,这项研究有望用于治疗母系遗传的线粒体病。
Li等人利用ZFN技术能在染色体上精确定位的优势,通过“剪切”和“粘贴”基因,在丈 验小鼠体内实现了血友病治疗,避免了传统基因疗法带来的插入诱变风险,首次取得了基因组编 辑在基因疗法上的突破。
构建模式动物
根据人类疾病所构建的动物模型,对研究这些疾病的发生及其治疗有着重要意义。基因打靶技 术是在ES和同源重组技术的基础上发展起来的,模型构建耗时长、成本髙.旦模式动物的选择受 到ES细胞的限制。
基因编辑新技术不受ES细胞的限制?效率高?速度快?且定点编辑更加精确,可在多种细胞及生 物体的特定位点进行切割和修饰。构建转基因小鼠第一人Jaenisch与其同事最近利用CRISPR- Cas系统又构建了携带特
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