生物化学参考RNA的合成及调控.pptxVIP

RNA的合成及调控RNA Synthesis（Transcription）and Regulation宋潇达 357169093@qq。com2014.12 1日程表：12月19日： 转录与基因表达调控12月22日： 蛋白质的生物合成-112月26日： 蛋白质的生物合成-2 生化讨论-2 01月02日： ??????? 教务处改为01月04日01月09日： 复习答疑01月10日： 上午考试（旁听学生凭旁听申请表复印件参加期末考试） 2 目录Section 1. 本章总览Section 2. 转录 Section 3. 转录的后加工Section 4. 原核转录的调节Section 5. 真核转录的调节Section 6. 基于RNA的RNA复制3 4电镜下的转录DNASection 1.本章总览RNA 5转录泡（转录单位）启动子RNA 聚合酶DNA模板链方向：5’-3’ 6模板链真核生物的mRNA后加工DNA编码链DNA编码的遗传信息的传递 7Section 2. 转录转录的过程：启动子的结合和转录起始 promoter binding and initation延长 elongation终止 termination 8原核生物RNA聚合酶核心酶 core polymerase: α2ββω全酶 holoenzyme: α2ββωσω 功能不明。SubunitGeneNumberMass（kDa）αrpoA237βrpoB1151β’rpoC1155σrpoD170ω…1… 9原核RNA聚合酶组分与结合率关系大肠杆菌含有多种 σ 亚基. 它们和核心酶绑定后向下游搜寻（seek out）不同的启动子，开始转录起始。结合Kdt1/2全酶+DNA10-7~3 sec全酶+启动子10-14~2-3 hr核心酶+DNA10-12~60 min EnzymeRNAs SynthesizedRNA polymerase Ilarger rRNAs（28S，18S，5.8S）RNA polymerase IImRNAs，most small nuclear RNAs（snRNAs and snoRNAs），most microRNAs，telomerase RNARNA polymerase IIIother small RNAs，tRNAs，5S RNARNA polymerase IV，V（Plants）siRNAs10真核RNA聚合酶Amanita phalloidesα-Amanitaα-鹅膏蕈碱 起始 Initiation全酶绑定双链DNA，向下游移动直到σ识别启动子序列。然后绑定启动子DNA形成转录复合体。在启动子区域中有两个保守序列。-10 TATA box (Pribnow box) 5-TATAAT-3 -35 box （Sextama box） 5-TTGACA-3 当RNA聚合酶绑定后，~-9 to +3 转录泡打开，双链被解旋，合成RNAupstream（上游）downstream（下游）11 12启动子结合区域 Bubble OpeningElongationRNA聚合酶需要超螺旋双链DNA，镁离子及NTPs作为底物，每步反应释放出PPi。RNA合成的方向为5’ 到 3 RNA聚合酶不需要引物，但有核酸外切酶活性及预读功能（proofreading）。转录产物有leader and trailer segments。13 14Elongation+1位为起始位点，往往为嘌呤。RNA聚合酶离开启动子区域（约+6~10位），σ因子解离，剩下核心酶继续复制约50bp/s需要两个DNA拓扑异构酶在前后部分。当RNA聚合酶离开启动子区域，另一个RNA聚合酶可以结合到启动子区域。 15Polymerization Polymerization5 Residue5‘ 末端经常为pppA 或pppG，保留磷酸。16 17终止 Termination1. Hairpin方式这是一个终止位点。是富含重复G：C的DNA末端序列区域，几乎不含A：T，转录单元的末端含有很短的A：T配对区域。NusA蛋白能够在终止位点结合，polyU部分到发卡结构部分处于松弛状态，很容易从DNA模板上分离开来。 18终止 Termination2. Rho (?) factor是一个依赖于ATP的六聚体解螺旋酶。在转录RNA中，能够特异性的识别序列。沿着5’~3’的方向直到捕获转录泡，再利用解螺旋酶的活性从RNA模板上将其解开，从而终止转录。 The RNA transcript.19 20转录与抗生素：利福平：与依赖DNA的RNA多聚酶的β亚单位牢固结合，抑制细菌RNA的合成，防止该酶与DNA连接，从而阻断RNA转录过程，使DNA和