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mricro软件在脑表面结构重建中的应用 在图像医学和计算机科学的快速发展下，三维重建技术成为一个研究热点，在临床诊断和治疗中发挥着重要作用。然而,对人脑表面结构的关注和研究却相对稀少。推测主要的原因有以下3方面:(1)目前对脑表面三维重建的价值尚缺乏足够的重视,国内相关的文献发表极少。(2)由于脑表面沟回等结构走行方向迂曲、形态结构变化较大、个体之间差异大及颅盖和头皮软组织的影响,目前的影像学技术对脑表面沟、裂、回等解剖结构的三维显示仍然非常困难。(3)目前虽然有许多的软件能够不同程度地实现脑表面结构的显示,如MRIcro、SPM、Analyze、SureFit等,但是各种软件分别由不同的研究机构开发,且主要兴趣点集中在脑科学的研究,不但安装、操作过程复杂,各种软件之间的通用性和结果的一致性等问题都不确定,因而临床的应用更是受到限制。 1990年日本医师Katada借助MR SE序列T2WI厚层检查技术对脑表面进行扫描(surface anatomy scanning, SAS),结合图像黑白反转,显示脑表面的沟回等结构。目前,该技术已经成为商品化的软件在一些MR机上安装。虽然SAS技术并不是真正意义的脑表面三维重建,但我们仍然从中看到了这一技术的潜在价值,作者尝试利用MRIcro软件的脑表面结构三维重建技术,并评价重建效果。 1 材料和方法 1.1 男、女试验 2002—2005年间,共对33例正常志愿者行脑功能磁共振试验,其中男17例,女16例,年龄21～39岁,平均25.6岁。作者提取33例志愿者的矢状位3D梯度回波扫描序列(3D flash)图像,利用MRIcro软件行三维脑表面重建。 1.2 颅内颅内圈 检查采用Siemens Magnetom Sonata 1.5T高场强超导型磁共振机,相控阵头颅线圈。3D flash扫描序列检查参数:TR/ TE=30 ms/ 5 ms,视野(FOV)220～240 mm×220～240 mm,矩阵256×256×196,层厚1.2 mm,20%间隔,矢状位扫描,与大脑镰平行共扫描128～144层,扫描时间5 min 40 s。 1.3 脑表面结构的变化 将3D梯度回波扫描图像以Dicom格式刻盘后,在Windows2000下使用MRIcro软件打开并进行脑表面结构的三维重建。处理过程包括:通过MRIcro软件将Dicom格式转变为iso格式,使图像可以在MRIcro软件中处理;进行各向同性化转变,将原始图像转化为像素大小为1 mm×1 mm×1 mm的图像;将脑底以下的颈椎部分去除,使大脑三维重建时能够去除颈部的干扰;使用skull strip命令剥除颅骨和头皮等软组织;在3D窗下通过调整角度来显示不同方位的脑表面结构;分别将上、下、左、右、前、后、左顶前、左顶后、右顶前、右顶后10个方向的重建图像以JPG格式保存。 1.4 脑沟的显示结果 由有经验的神经放射诊断医师3人集体分析上述图像。观察并分析:正常人大脑凸面各主要脑回、脑沟的显示情况。采用Tsuchiya等的评价方法,根据显示优劣分为好、中、差和不显示4等,分别得3分、2分、1分和0分。表面解剖结构的细节显示清楚时为3分;表面解剖结构能够显示但不十分清楚时为2分,表面解剖结构可见但不能与邻近结构区分时为1分,不能评价时为0分。 2 脑回、脑沟的结构 利用MRIcro软件的脑表面结构三维重建技术进行脑表面重建的所用病例均除去了颅盖和头皮软组织信号的影响,重建出比较满意的大脑凸面脑回、脑沟的三维结构。33例左右半球各主要脑回、脑沟的显示情况和平均得分见表1。 中央沟、中央后沟、中央后回、中央前沟、中央前回、顶内沟、顶上小叶等结构显示最好,平均得分都在2.80以上;外侧沟、额上回、角回、缘上回、额上沟、额下沟、额下回、额中回、颞上沟、颞上回、颞中回和颞下沟等也显示非常好,平均得分在2.52～2.77之间;颞下回显示最不理想,但是平均得分也在2.39(图1～4)。 3 mri扫描图像结构 非侵入性地直接观察活体脑表面结构对临床诊断 和治疗有着特殊的意义,但是由于走行方向迂曲、信号或密度差别较小、形态结构变异较多及颅盖、头皮软组织等因素影响,对脑表面脑回和脑沟等解剖结构的三维重建目前尚无理想的方法,临床上未得到普遍应用。1990年日本医师Katada借助MR SE序列T2WI厚层检查技术对脑表面进行扫描(SAS),结合图像黑白反转,显示脑表面的沟回等结构;此后的Tsuchiya等发展了SAS技术,借助半傅立叶单次激发快速扫描(HASTE),结合图像黑白反转,显示脑表面的沟回等结构,并通过临床病例的检查,充分肯定 了SAS对 脑表面解剖的显示能力及在指导外科手术中的价值。然而SAS并非真正三维重建图像,存在图像重叠、无法进行两侧