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西藏林芝地区不同品种葡萄果实表皮微生物群落结构组成分析
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何 萍,王健强,高 潭,陈诚欣,徐雨婷,简 阅,刘盼盼,张二豪
(西藏农牧学院 食品科学学院,西藏 林芝 860000)
西藏林芝市位于西藏东南部,雅鲁藏布江中下游,平均海拔3 100 m,其独特的高原气候类型赋予了该地区昼夜温差大、光照充足和紫外线强的特点,为果树种植提供了得天独厚的生长环境,因此,素有“西藏江南”和“水果之乡”的美称。
葡萄(Vitis viniferaL.)为葡萄科葡萄属多年生木质藤本植物,是栽培历史悠久、栽培面积最大的水果之一[1]。目前,全球葡萄品种数量巨大,超过23 000种[2],由于其富含维生素、蛋白质、有机酸及矿物质等营养成分深受消费者的青睐[3-5]。在我国,葡萄主要用于鲜食,其次是酿酒和制干[5],但从世界范围来看,葡萄主要用于酿酒,其次是鲜食和制干[6]。随着人们生活水平的提高和健康意识的增强,葡萄酒作为一种功能保健品深受广大消费者的青睐。葡萄酒具有抗癌、降血糖、抗氧化及增强免疫力等功效[7],但葡萄酒品质受葡萄品种、酿造工艺、产地和表皮微生物等因素影响[8]。葡萄酒酿造的本质是一系列微生物发酵和代谢的过程,其中酵母菌、乳酸菌、醋酸菌和霉菌在发酵过程中扮演着重要角色[9],而这些微生物主要来源于葡萄表皮和发酵设备[10-11]。研究表明,在葡萄酒酿造过程中,葡萄果实表皮微生物葡糖杆菌属(Gluconobacter)等能促进酯类物质的合成,进而改善葡萄酒的品质,乳酸菌属(Lactobacillus)等则会产生异味,影响葡萄酒的感官[12];本土酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)能够显著提升酒的风味物质[13];增芳德葡萄表皮上的非酿酒酵母泽普林假丝酵母(Candida zemplinina)能增强葡萄酒的口感[14]。葡萄表皮微生物受产地、品种和环境等因素影响,张世伟等[15]研究表明,不同品种葡萄表皮微生物群落结构组成存在明显差异;赵昱等[16]研究表明,不同产区酿酒葡萄表皮微生物存在一定的差异。综上所述,葡萄表皮微生物在葡萄酒酿造过程中扮演着重要角色,且受产地、品种、气候和环境等因素的影响。西藏林芝市具有独特的地理位置和气候类型,蕴藏着丰富的微生物资源,因此,探明林芝地区不同品种葡萄果实表皮微生物群落结构组成,对筛选利用功能微生物具有重要意义。
本研究利用高通量测序技术对西藏林芝地区的‘夏黑’、‘火焰无核’、‘茉莉香’和‘玫瑰香’葡萄果实表皮微生物群落结构组成进行分析,揭示不同品种葡萄果实表皮微生物多样性,为葡萄种植管理和筛选利用本土优质的微生物资源提供理论参考。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.1.1 样品的采集与处理
2021年8月从西藏林芝市嘎玛农场(纬度29°2444.74N,经度94°2626.86E)采集‘夏黑’(Summer Black)、‘火焰无核’(Flame Seedless)、‘茉莉香’(Jasmine)和‘玫瑰香’(Muscat Hamburg)共4个品种的葡萄果实样品,编号分别为XH、BL、ML、MG。随机选取10株生长一致的葡萄树(10年生),用无菌剪刀分别采集每株葡萄树上、中、下部位的成熟果实,并混合均匀,置于无菌袋中,每组3个重复,-20 ℃保存备用。
称50 g葡萄样品,加入200 mL 0.1 mol/L磷酸盐缓冲液(phosphate buffered solution,PBS)(pH7.0),200 r/min涡旋30 min,超声处理20 min,经0.22 μm无菌滤膜过滤后,取出滤膜并剪碎置于无菌离心管中[16],-80 ℃保存备用。
1.1.2 主要试剂
DNeasy Plant Mini Kit提取试剂盒:美国Qiagen公司;Taq脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)聚合酶(5.0 U/μL)、脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphate,dNTPs)(5 mmol/L)、普通DNA产物纯化试剂盒:天根生化科技(北京)有限公司;琼脂糖、Qubit2.0 DNA检测试剂盒:美国Invitrogen公司;其他试剂均为国产分析纯。
1.2 仪器与设备
TD-GelX 1520凝胶成像系统、T100聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)仪:美国Bio-rad公司;WS600电泳仪:万生博朗电子有限公司;NanoDrop2000微量分光光度计:美国Thermo公司;5424、5418R离心机:德国Eppendorf公司;IMS-20制冰机:上海精密仪器仪表有限公司;UPT-I-5T优普系列超纯水器:四川优普超纯科技有限公司。
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