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m6A识别蛋白HuR调控lncRNATRG-AS1抑制结直肠癌生长的机制研究
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柴小兵,张利,褚菲菲,吴慧丽
结直肠癌(CRC)是一种侵袭性癌症,发生在结肠或直肠,是全球第三大常见恶性肿瘤[1]。尽管治疗CRC可采取手术、化学疗法、放射疗法和分子疗法,但CRC患者的存活率仍然较低[2-3]。因此,深入了解CRC的发病机制对于制定新的治疗策略和改善CRC患者的预后具有重要意义。近年来,RNA甲基化修饰尤其是N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)甲基化修饰被证实在肿瘤的进展中发挥重要作用。m6A甲基化修饰是一个动态过程,主要受甲基化转移酶复合物、去甲基化酶、结合蛋白的调控[4]。人类抗原R(HuR)是m6A甲基化修饰的识别蛋白。HuR在CRC中高表达,沉默HuR可抑制CRC细胞转移[5]。但其具体调控机制尚不完全明确。生物信息分析显示,长链非编码RNA(lncRNA)T细胞受体γ位点反义RNA1(T cell receptor gamma locus antisense RNA1,TRG-AS1)上存在m6A位点,且TRG-AS1能与HuR蛋白相互作用。相关研究显示,沉默TRG-AS1可明显抑制肝癌细胞增殖、迁移、侵袭[6]。但HuR能否通过调控TRG-AS1影响CRC细胞恶性生物学行为尚不明确。因此,本研究旨在探究HuR对CRC细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭的影响及其作用机制。
1 材料与方法
1.1 材料 收集2019年5月—2021年5月在郑州大学附属郑州中心医院首次确诊为CRC患者的癌组织以及距离癌组织3 cm处的癌旁组织,共19对。所有组织收集后立即冻存于液氮中。患者均签署知情同意书,本研究得到郑州大学附属郑州中心医院伦理委员会的批准(伦理号:201901)。人正常结肠上皮细胞NCM460及CRC细胞HCT116、SW480、LO?VO均购自上海佰晔生物科技中心。35只5周龄的雌性BALB/c裸鼠购自广州锐格生物科技有限公司[生产许可证号:SCXK(粤)2021-0059]。HuR小干扰RNA(si-HuR,序列:5′-UCAAAGACGCCAACUUGUA-3′)及其阴性对照(si-NC,序列:5′-UAAGGCUAUGAAGAGAUAC-3′)、HuR过表达物(OE-HuR)及其阴性对照(OE-NC)、TRG-AS1过表达物(pcDNA-TRG-AS1)及其阴性对照(pcDNA)均购自河南睿英生物公司;DMEM培养基、胎牛血清购自武汉益普生物公司;EpiQuik M6A RNA甲基化定量检测试剂盒(比色法)购自厦门慧嘉生物公司;CCK-8试剂盒购自杭州昊鑫生物公司;Annexin V-FITC/PI细胞凋亡检测试剂盒购自翌圣生物科技公司;兔源一抗HuR、m6A、IgG、GAPDH及羊抗兔IgG二抗均购自英国Abcam公司。ABI-7500实时荧光定量PCR仪购自北京赛百奥科技有限公司;蛋白电泳仪购自北京六一生物科技有限公司;FK-SY96A酶标仪购自山东方科仪器有限公司;流式细胞仪购自上海睿钰生物公司;XDS-100D型倒置光学显微镜购自上海蔡康光学仪器有限公司。
1.2 方法
1.2.1 细胞培养 将NCM460、HCT116、SW480、LOVO细胞置于含有10%胎牛血清的DMEM培养基中,并在37℃、5%CO2条件下培养。
1.2.2 比色法检测m6A含量 按照EpiQuik m6A RNA甲基化定量检测试剂盒(比色法)说明书检测组织和细胞中的m6A含量。
1.2.3 实时荧光定量PCR(qPCR)检测组织和细胞中TRGAS1表达 使用TRIzol提取组织和细胞中RNA,将RNA逆转录为cDNA。以cDNA为模板在ABI-7500实时荧光定量PCR仪上进行实时荧光定量PCR。反应体系:上、下游引物各1μL,cDNA模板1μL,SYBR premix 10μL,补无菌水至总体积为20μL。反应条件:95℃预变性10 min;95℃变性10 s,60℃退火30 s,共45个循环。以GAPDH为内参,通过2-ΔΔCt法计算TRG-AS1的表达水平。引物及序列见表1。
Tab.1 qPCR primer sequences表1 qPCR引物序列
1.2.4 Western blot检测组织和细胞中HuR蛋白的表达 在冰上用RIPA裂解缓冲液裂解组织匀浆和细胞30 min,10 000 r/min离心20 min,收集上清液,通过BCA试剂盒检测蛋白质浓度,将30μg蛋白质进行10%十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳。电泳分离后将蛋白质转移到PVDF膜上,再用5%脱脂奶粉封闭1 h,经TBST洗涤后,将PVDF膜与一抗HuR(1∶2 000)、GAPDH(1∶1 000)在4℃下
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