肿瘤家系研究--从遗传学到基因组学课件.pptxVIP

肿瘤家系研究--从遗传学 到基因组学 第 一 阶段 到基因组学 收集临床资料 完整的系谱应有三代以上有关患 谱 本研究的对象为核心家系和患病 的对象 鼻烟癌分子遗传学研究 Genome-wide scan for familialnasopharyngeal carcinoma reveals evidence oflinkage to chromosome 4 对32个讲广州方言的鼻烟癌高发家系，进行全 基因组扫描和连锁分析、精细定位及单体性分 析，将鼻烟癌的遗传易感区定位在4号染色体 上，为易感基因的克隆提供了基础 星 D 位 点 短 串 联 重 复 序 列 ( s h o r t t AA NN 人类世代传递时，生殖细胞减数分裂(meiosis)中父方 与母方的同源染色体可发生交换/重组(cross- over/recombination)。 染色体上标记位点与疾病位点间发生重组的机率取 决于两位点间的距离。 距离越近那么在世代传递中重组机率越小，亦即染 色体上两个紧密毗邻的位点一起传递给某个子代的 机率高于两远隔的位点，此即连锁不平衡(linkage disequilibrium)。 关联及连锁分析均依据此原理来发现与疾病呈连锁 不平衡的多态标记，由此确认复杂病易感基因在染 色体上的位置 s e d l i n k a g e 记 微 物 卫 观 记 引 物 分 别 标 有 F A M 标标 星星 我们采用多重PCR方法扩增微卫星DNA， PCR反应体系总体积为5 μl，包含50 ng人基因 组DNA，10×PCR缓冲液0.5 μl，25 mmol/L MgCl2 0.6 μl，10 mmol/L dNTP 0. 1 μl,10 μmol/L引物0.025 μl/对，5 U/μl Taq酶0.05 μl， 1. 1 μg/μl Taq StartTM抗体0.05 μl，抗体缓冲 液〔10 mmol/L Tris-HCl(pH 7.0),50 mmol/L KCl, 50% glycerol〕0.2 μl 。PCR反应在96孔薄 壁板中进行，PCR仪为Perkin-Elmer-Cetus 9600。 A 扩 增 方 法 基 因 在 分 0 型 观μ l P C R 反 应 产 物 中 将每个样本不同位点的基因型 分 析 OO u r f i n d i n g s p 肝癌的遗传学背景的研究 ，正在国家 学研究进展 (1)是少数的大家系，并从此家系成员中获得DNA信 息，其优点是所有患者基本上一个遗传病，并由 单一基因突变引起； (2)是收集大量的小家系。 一.疾病基因与遗传标记进行连锁分析以诊断疾病， 然而要认识这种关系就需要： 二.尤其是稀少的疾病，患者在年幼时死亡。这时 采取两种方法 ①有足够数量家系来确定这种连锁； ②有适当可提供信息的DNA标记。 总结