基于转录组学的拟南芥AtNDX下游潜在靶基因挖掘与分析.pdfVIP

浙江理工53卷，第5期，2025年9月

JournalofZheSci-TechUniversity

D

OI:10.3969/j.issn.1673-3851(n).2025.05.007

基于转录组学的拟南芥AtNDX下游潜在

靶基因挖掘与分析

王洁瑶，马蓉，邢孔丫，柯丽萍，华学军

（浙江理工大学生命科学与医药学院，杭州310018）

摘要：植物线粒体在受到环境胁迫时会产生逆向信号，通过调节核基因的表达来协调植物生长和抗逆的平

衡，但其内在作用机制还有待深入研究。首先对拟南芥SSR1基因突变体（ssrl-2）、ssrl-2抑制子（sus3）、sus3回补

株系（sus3C)及野生型Wassilewskija（WS）植株的根进行转录组测序；其次利用主成分分析和Pearson相关系数评

估转录组数据之间的相关性，绘制差异表达基因的火山图和相关性聚类分析热图；最后结合KEGG和GO分析，筛

选同时受线粒体胁迫和AtNDX调控的基因，分析AtNDX在线粒体胁迫下调控植物生长发育的作用机制。结果表

明：4个材料的高通量测序数据重复性好，且ssrl-2与sus3C高度相关，sus3C能互补sus3抑制子突变造成的影响；

筛选到线粒体胁迫下受AtNDX负调控的基因有288个，受AtNDX正调控的基因有178个；利用实时荧光定量

PCR技术对筛选出的15个在线粒体胁迫下受AtNDX调控的潜在下游靶基因进行了验证，发现这些基因均在植物

生长发育和细胞代谢过程中发挥重要作用。该结果表明，AtNDX通过调控根系发育和细胞代谢相关基因的表达参

与线粒体逆向信号的响应和植物生长发育调节，为深入解析植物线粒体在平衡生长发育和胁迫响应中的作用提供

了重要线索。

关键词：拟南芥；转录组；AtNDX；下游靶基因；线粒体胁迫

中图分类号：Q756文献标志码：A文章编号：1673-3851（2025）09-0646-10

引文格式：王洁瑶基于转录组学的拟南芥AtNDX下游潜在靶基因挖掘与分析LJI.浙江理工大

学学报（自然科学53(5):646-655.

Mining

ReferenceFormat:WANGJieyao,MARong,XINGKongya,etal.Ianalysisofpotentialtargetgenes

gand

1nAraboi-lechUniversity,2025,

downstreamofAtNDXipsisthalianabasedontrans

53(5):646-655.

Miningandanalysisofpotentialtargetgenesdownstreamof

AtNDXinArabidopsisthalianabasedontranscriptomics

WANGJieyao,MARong,XINGKongya,KELiping,HUAXuejun

(CollegeofLifeSciencesandMedicine,ZhejiangSci-TechUniversity,Hangzhou310018,Chin

Abstract:Plantmitochondriaproduceretrogradesignalsunderenvironmentalstresstoregulate

nucle