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乳酸菌基因组学研究进展 刘辉，季海峰，单达聪，王四新，王晶，张董燕，王雅民，侯成立 （北京市农林科学院畜牧兽医研究所，北京 100097） 摘要：乳酸菌基因组学的研究有助于揭示乳酸菌的遗传和代谢机制，通过分析相关功能基因与益生功能的联系，能够充分发挥乳酸菌应用潜力。本文就乳酸菌基因组基本特征、代谢特点、重要功能基因、乳酸菌的比较基因组学进行了综述。 关键词：乳酸菌；基因组；基本特征；代谢特点；功能基因；比较基因组学 乳酸菌是一类发酵糖类以乳酸为主要代谢终产物的兼性厌氧细菌的总称，根据代谢产物的种类可分为同型发酵乳酸菌和异型发酵乳酸菌(张文羿等，2008)。乳酸菌在细菌分类学上划分为23个属，包括乳杆菌属、乳球菌属、肠球菌属、双歧杆菌属、片球菌属、链球菌属等。乳酸菌是动物胃肠道的正常菌群，能够代谢产生乳酸、乙酸、细菌素等活性物质，抑制有害菌繁殖，调节消化道微生态，提高机体免疫功能和生产性能等(黄庆生等，2002；Bielecka等，2002；张常明等，2006)。 为了发挥乳酸菌在畜禽养殖中的应用潜力，早期乳酸菌的研究工作多集中于菌种的分类和菌株的筛选，并通过构建动物模型对部分益生特性进行验证。随着分子生物学理论和生物技术的发展，逐渐转向对乳酸菌分类鉴定、基因功能及其代谢途径进行分析研究。采用全基因组鸟枪法测序的方法，第一株乳酸菌即乳酸乳球菌的全基因组测序项目于2001完成（Bolo