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多酚类植物基因组DNA提取方法的研究
孙志栋陈惠云
(宁波市农科院,宁波315040)
摘要: SDS法和CTAB法是提取植物基因组DNA的两种基本方法。本文以多酚类植物棉花为
P。’—一_c一
研究材料,对SDS法、CTAB法、改莨SDS法和改良CTAB法进行了比较研究,结果表鹳:改进的SDS
法和改进的CTAB法分别优于原SDS法和原CTAB法。两种改进的方法对提取棉花基因组DNA有异曲
同工之妙。DNA的得率不仅与提取方法有关,而且与棉花取材的部位不同有关。改进的CTAB法DNA
得率高于改进的SDS法;棉花不同部位材料采用改进的CTAB法提取基困组DNA,其DNA得率的高
低依次为花药花瓣叶片纤维。由改进方法提取的棉花基因组DNA能完全双酶切,满足SSR和AFLP
等后续分子生物学研究的需要。而且两种改进的方法也适应于其它植物基因组DNA的提取,其中改进
的SDS法尤适于高蛋白、粘多糖类植物基因组DNA的提取,而改进的CTAB法则适于多酚类植物基因
组DNA的提取。
关键词:多酚;垆物;匹匿垂互雯区互淦DNA提取:落§验
。 乙 /
DNA提取是从事植物分子生物学研究重要技术环节之一。提取的DNA片段大而蛋白质、RNA
及多糖、多酚类物质污染少,是实验结果可靠性和重复性好的保证。棉花是典型的多酚类植物,
其叶片、种子中富含多酚类物质,而纤维中富含多糖类物质,这对高质量提取DNA带来困难。
目前能有效去除植物多糖、酚类化合物和其他杂质的DNA提取方法认为主要有两种:一种
是CsCl密度梯度离心法f1、2】,另一种是CTAB法p、“】。前者由于仪器设各要求较高,且成本高、
费时间,使用受到限制,后者不需要贵重仪器,操作较为简单,能广泛适用于大多数植物的核酸
提取,纯度亦能满足后续分子生物学操作的要求回,应用日趋广泛。棉花的组织器官富含棉酚,
是一类相当活跃的化合物,在植物细胞破碎时易与核酸作用形成稳定的不可逆的复合物¨’7J。因
此,提取高质量的棉花基因组DNA现在似乎更倾向于改进的CTAB法。
获得高纯度的DNA,是AFLP分子标记扩增的关键技术之一。为了筛选出既DNA质量高又
操作方便的棉花基因组DNA提取方法,以保证后续分子生物学的研究,我们以棉花的花药、花
瓣、叶片和纤维等为材料,对DNA提取方法中的SDS法和CTAB法及其相应的改良方法作了反
复试验和比较,并应用到其它植物材料进一步进行验证。结果如下。
1材料和方法
1.1材料
供试材料:棉花叶片、纤维、花瓣和花药等。烟草、芦荟、蚕豆、玉米均取自叶片。螺旋藻
为皿养藻种。
实验试剂:所用试剂均为分析纯,并且除聚乙烯吡咯烷酮(Poly
十二烷基磺酸钠(SodiumDodecyl
20rain。
1.2方法
mmol/LEDTA
SDS法提取缓冲液通常为:500mmoI/LNaCI,100mmol/L8,O),50
Tris-C1(pH
KAC。
13-巯基乙醇(用前加入),20%SDS。另高盐为5mmol/L
(pH8),10mmol/L
SDS法根据Clark(1997)”1的方法操作:
(1)称取鲜样品29,置于预冷的研钵内(在冰块上操作),加石英砂少许,快速匀浆,或直
接用液氮磨成粉。
(2)加15ml提取缓冲液,lml20%SDS,混匀65C保温10min,并不时旋转混匀。
(3)加5ml5mol/LKAC,混匀后冰上放置20-30rain。
淀核酸。
(5)20009,4C离心20min,弃上清,晾干沉淀5rain。
50TE缓冲液溶解沉淀并加7p.1RNaseA贮液,37C保温1h。
(6)加700“1
(7)加入75—3moI/LKAC,轻弹混匀,离心15min。
(8)取上清,加500pI异丙醇,轻轻混匀,室温下放置5min。
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