中国西部5个地方鸡品种和文昌鸡微卫星标记分析.pdfVIP

634 第十一次全国畜禽遗传标记研讨会论文集 中国西部5个地方鸡品种和文昌鸡微卫星标记分析古 张建勤1，陈宏1y‘，孙兆军2¨，刘小林1，强巴央宗4顾玉兰1 (1．西北农林科技大学动物科技学院，陕西省农业分子生物学重点实验室，陕西杨凌，712100；2．宁夏大 学新技术应用研发中心，宁夏银川750021；3．徐州师范大学细胞与分子生物学研究所，江苏徐州221116； 4．西藏大学西藏农牧学院牧医系，西藏林芝86000) 摘要：采用微卫星标记方法，对中国西部宁夏固原鸡．西藏藏鸡、陕西省的略阳鸡，太白鸡、陕北 鸡和南方海南文昌鸡共6个品种，560个个体19个微卫星位点的遗传结构和品种间血缘关系进行了分析 研究．结果表明中国地方品种均-,艮gr丰富的遗传变异，其中藏鸡具有极为丰富的遗传变异，杂合度达到 0．8220．品种问存在极显著的遗传分化．固原鸡和文昌鸡的遗传距离较近，可聚为一类．藏鸡与这两个 品种鸡均遗传距离较远，单独聚为一类；陕西的3个品种鸡之间遗传距离较近，聚为一类．并发现LEl212 位点可以作为区分特定地域品种鸡的特定标记位点． 关键词：鸡；微卫星标记；遗传变异； 遗传距离 对于我国地方品种特殊优质基因的研究是目前我国资源研究的热点和重点。我国具有丰富的家鸡资 源，开发和利用家鸡优质性状及研究控制优良性状基因将对我国家禽业的发展具有非常重要的意义。由 于我国的禽类资源主要集中在东南地区，而西北部相对较少【lJ。对于西部的禽类资源大多都认为蕴涵的 遗传资源较为贫乏，遗传变异范围较窄，又由于地处相对偏远、交通非常不便的山区，所以很少被研究 和开发利用。目前对于陕西省陕北鸡和太白鸡的研究还未见研究报道。随着我国对西部资源的开发与利 用力度的加大，西部的禽类资源也被逐渐开发和深层次的研究。本研究就是利用微卫星标记的方法研究 揭示西部5个品种鸡和南方文昌鸡的群体遗传结构及之间的亲缘关系，旨在为下—步更深入的研究提供 一定的理论依据。 1材料与方法 1．1材料 应用随机抽样在宁夏固原采集112只固原鸡(GC)血样，在海南罗牛山文昌鸡保种场采集文昌鸡 C)血样 (WC)221只血样，在西藏林芝农牧学院采集藏鸡frc)loo只血样，在陕西省略阳县采集略阳鸡(L 76只，在陕西省太白县采集太白鸡①c)32只，在陕西省陕北地区采集近乎灭绝的陕北鸡(SC)19只，每 只鸡翅静脉采血2～3mL，加入肝素抗凝剂，-20℃以下保存备用。用酚氯仿抽提法提取基因组DNA。 1．2引物和PCR扩增 本研究所用19对微卫星引物均来自于GenBank公布的微卫星位点，采取随机抽取的原则，同时考 虑扩增片段为180-300bp范围内，上下游引物的长度介于19 bp-23bp之问。PCR扩增后，将变性产 物在8％非变性聚丙烯酰胺凝胶中电泳，银染显带【2．引，并进行群体遗传结构分析。 2结果与分析 2．1獬遗传结构分析 2．1．1各群体遗传结构的遗传参数 6个鸡群体19个位点的平均杂合度、平均Shannon信息含量和平均有效等位基因数如表l所示。结 ·基金项目：国家自然科学基金项目，西北农林科技大学校青年专项 孙兆军(1962一)，男．宁夏银川市人，研究员，硕士生导师，主要从事生物技术研究． (October 1 No．1 Animal Bulletin 2008)V01．1 Biotcchnology 果表明，藏鸡群体各遗传参数均为最高，分别为0．8220、1．7433和4．3166，具有极为丰富的遗传多态， 其次分别为固原鸡和文昌鸡。而3个陕西地方品种各遗传参数相对较低，其中近乎灭绝的陕北鸡最低， 遗传参数分别为0．6177、1．0986、2．8943。 表l群体遗传结构的遗传参数 !生!!!生型生E曼g些!堡坚21巴巳!!呈!j2巳墅g坠望 群体 平均杂合度 Shannon信息含量 有效等位基因数 Popul