基于蛋白质相互作用和网络的药物设计.pdfVIP

基于蛋白质相互作用及网络的药物设计 来鲁华 北京大学化学学院，北京大学理论生物学中o． 分子动态与稳态结构国家重点实验室．北京100871 【摘要】 蛋白质相互作用及蛋白质网络研究是后基因组时代药物设计的新关注点。 作者的实验室针对蛋白质一蛋白质相互作用规律进行了研究；发展了进行蛋白质界 面分析及分类的方法；建立了定量计算蛋白质一蛋白质结合自由能的统计平均势方 法，发现蛋白质界面上存在着弱的氢键作用模式；发展了可用于非同源蛋白质非连续 功能位点的嫁接方法，并在实际体系的研究中取得了成功。 【关键词】 蛋白质一蛋白质相互作用；蛋白质作用网络；界面分析；平均势方法；蛋白 质功能设计 Protein——Protein DrugDesignTargeting InteractionandProteinNetwork IJai Luhua for State Structural ofStableandUnstable of KeyLaboratory Chemistry Species．College forTheoretical 100871 Chemistry，Center Biology，PekingUniversity，Beijing interactionand networkm issuesfor in 【Abstract】Protein—proteinprotein key drugdesign the the era．Wehavestudiedbasic interac— post—genome principlesgovemingprotein—protein tionsAusefultoolforinterface hasbeen and tointerfaceelassifica— analysis developedapplied tion．Statisticalhavebeen to calculate potentials developedquantitativelyprotein—protein free bonds werefoundtocontribute bindingenergy．Weakhydrogeninvolvingcarbon—hydrogen for to non—homolo— protein—proteinbinding．Functionalproteindesignstrategy significantly of siteswasestablishedand in applied gnus．non—continuoustransferringbinding successfully design． protein