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西农萨能奶山羊泌乳期不同组织PITX2基因的甲基化谱研究
赵海谕1,周瑞2,周新字2,甘鹏2,潘传英。,雷初朝‘,蓝贤勇1。’,陈宏“+
1.西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌,712100:2.西北农林科技大学生命科学学院陕西杨凌,712100
关键词:西农萨能奶山羊;泌乳期;PITX2基因;甲基化
摘要:通过BSP研究发现,西农萨能奶山羊泌乳期不同组织PITX2基因启动子区甲基化水平较低,其中脂
肪的甲基化水平最低(0.41%),显著或极显著低于心脏、脾脏、肌肉和乳腺组织。
引言
目前,我国奶山羊业稳定、健康、持续发展的关键问题是解析奶山羊泌乳的分子机理。PITX2基因属
于PTX亚家族,在动物脑垂体、器官发育、左右不对称发育过程中起重要作用,并参与调控WnVlB信号通
路,该基因突变导致人类多种遗传疾病发生和小鼠胚胎死亡。因PITX2基因在下丘脑.垂体一肾上腺(HPA)
通路中调控翩和PRL基因的表达,故推测它在奶山羊泌乳调控中可能起着重要作用。作为最重要的表观遗
传修饰途径,尽管DNA甲基化不改变基因的核苷酸序列,但却依然调控着基因表达,调节着细胞的生长与
分化。为此,本研究以DNA甲基化为切入点,解析PITX2基因在奶山羊不同泌乳期的甲基化谱,为研究奶
山羊泌乳机制的研究提供科学资料。
材料与方法
西农萨能奶山羊泌乳期不同不同组织样品(心脏、肝脏、脾脏、肺、脂肪、肌肉和乳腺)采自陕西杨
凌;利用标准酚.氯仿法提取基因组DNA,经甲基化修饰试剂盒处理后,再通过Methprimer在线软件设计的
sx寸引物进行扩增,经纯化、TA克隆、鉴定后送20~30个阳性克隆测序,最后利用Fisher’S精确概率进行
cpG位点的甲基化差异分析,并借助在线软件Matlnspector预测转录因子。
结果与分析
在PITX2基因的C口G岛分析,扩增230
bp的启动子区片段(MPR2区域,含21个CpG位点)。心脏、肝
脏、脾脏、肺、脂肪、肌肉和乳腺中P/TX2基因甲基化水平分别为:3.70%、1.59%、4.31%、1.79%、
4、AP.2、CAP、SPI、SMAD、MYBL、HSF、TF
录因子的结合靶点。
讨论
本课题组前期研究发现,西农萨能奶山羊血样基因组DNA中PITX2基因启动子区甲基化对泌乳性能有
显著影响,而且低水平组具有高甲基化、高水平组具有低甲基化的特征,但不同组织该基因甲基化谱未
知。本研究通过泌乳期西农萨能奶山羊不同组织甲基化模式研究发现,该基因在西农萨能奶山羊泌乳期不
同组织中均维持一种较低的甲基化状态,与本课题组前期血样PITX2基因启动子区甲基化水平比较低(2%一
5%)的结果一致,可能与该基因在泌乳期不同组织中启动了大量基因表达有关。有趣的是,PITX2基因在
脂肪细胞中的甲基化水平明显低于在其他组织,与现有相关文献报道基本相符。例如:PITX2自身参与
肪细胞分化为脂肪细胞;Kruppel样转录因子在脂肪细胞的分化方面发挥着重要的作用,有些Klfs家族的转
录因子促进脂肪细胞的分化,有些则相反。为此,本研究推测KIfs家族中的某些促进脂肪细胞分化的转录
因子可能参与了用册基因在脂肪中的表达过程。当然,本课题组的下一步工作将是研究PITX2基因在不同
组织之间的表达及其与甲基化水平的关系,期望为奶山羊泌乳机制研究提供科学资料。
致谢
然科学基金项目(No,201
1JQ3009)项目资助。
4通讯作者
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