马铃薯StSnRK2.4基因的克隆及其序列特征分析.pdfVIP

2014年 4月 甘 肃 农 业 大 学 学 报 第 49卷 第 2期 77~83 JOURNAL0FGANSU AGRICULTURALUNIVERSITY 双 月 刊 马铃薯 StSnRK2．4基因的克隆及其序列 特征分析 李洋 白江平 ，毛娟 ，王丽 ，范阿棋 ，张俊莲 ，王蒂 (1．甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室，甘肃农业大学农学院，甘肃 兰州 730070； 2．甘肃省干旱生境作物学重点实验室，甘肃农业大学生命科学技术学院，甘肃 兰州 730070) 摘要：利用 RT-PCR技术从马铃薯普通栽培品种 陇‘薯 3号 ’试管苗根部扩增得到StSnRK2．4基因的cDNA 序列 ，并对其编码蛋白进行特性和结构分析．结果表明：该基 因序列全长 1083bp，编码 360个氨基酸，与烟草 SnRK2家族基因具有较高的同源性 ，达 95．56 ，已注册该基 因到 GenBank(No．JX280914)；该蛋 白分子量为 41．49kU，理论等电点为5．52，是一个不跨膜的膜内蛋白，主要存在于细胞核中，含有依赖cAMP／cGMP蛋白激酶 磷酸化、蛋 白激酶c磷酸化、酪蛋白激酶 Ⅱ磷酸化、酪氨酸蛋白激酶磷酸化和豆蔻酰化位点，丝氨酸／苏氨酸蛋白激 酶活性位点信号序列和蛋白激酶ATP结合区域信号序列 ，推测该基因功能与植物抗逆境胁迫有关． 关键词：马铃薯 ；StSnRK2．4基因；克隆；生物信息学分析 ；抗逆性 中图分类号：S532 文献标志码：A 文章编号：1003～4315(2014)02—0077—07 Cloningandanalysisofcharacteristicssequence ofStSnRK2．4geneinpotatoes LIYang ，BAIJiang—ping，MAOJuan ，WANGLi ， FANA—qi，ZHANGJun-lian ，WANGDi (1．GansuKeyLaboratoryofCropImprovementandGermplasm Enhancement，CollegeofAgronomy，GansuAgricultural University，Lanzhou730070，China；2．GansuProvincialKeyLaboratoryofAridlandCropScience，Collegeof LifeSciencesandTechnology，GansuAgriculturalUniversity，Lanzhou730070，China) Abstract：ThecDNA sequenceofStSnRK2．4werecloned byRT-PCR from thetest—tubeseedling rootsofcommonpotatocultivars L‘ongshu-3’．Thefullsequencecontained1083bpandencoded360ami noacids，andtherewerehighhomologieswiththeSnRK2genefamilyoftobacco，andthehomologywas 95．56 ．ThegenewasregisteredtoGenBank (No．JX280914)．Thebioinformaticsanalysisshowedthat themolecularweightofSnRK2．4was41．49kU ，thetheoreticalisoelectricpointwas5．52，andithadnot trans—membranedomainandmainlyexistedinthecellnucleuscontainingsomeactivesites，suchascAMP- andcGMP—dependentp