席宇《环境微生物学》13环境微生物学讲义2.pptVIP

Bacterial taxonomy is rapidly changing due to the acquisition of new data, particularly the use of molecular techniques such as the comparison of ribosomal RNA structure and chromosome sequences. This is leading to new phylogenetic classification. Developing trends 思考题 如何对科研或者生产中分离的一株微生物进行分类、鉴定和命名？ Thanks for your presence and advice！ * 由于对种的认识还可能出现分歧，所以目前微生物分类中所描述的种，在不同程度上都有人为的、暂时的性质，而且不可避免地出现一些混乱 * 有一种芽孢杆菌，除了在酷氨酸培养基上产生黑色素这一特性不同于典型的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)外，其余特性完全符合，于是就将这种芽孢杆菌称为枯草芽孢杆菌黑色变种(Bacillus subtilis var.niger)。 * 以上各学名中的第一个字是属名，为拉丁字名词，用以表示微生物的主要特征是葡萄球菌、曲霉、酵母菌、梭菌、加夫基氏菌，第二个字是种名，为拉丁字形容词，用以描微生物的次要特征是金黄色的、黑色的、四联的、引起破伤风病的、由巴拿马来的、巴斯德的。 * 红外吸收光谱脂类是生物体内的一类重要物质，由于它们在微生物不同属或种中具有特征性，微生物的脂类分析已用于细菌分类鉴定。 微生物存在有不同种类的细胞色素，近来已将它用作微生物分类的依据。 * 1)DNA中G+C的摩尔分数分析：每一个微生物中DNA的G+C的摩尔分数是稳定的，不随环境因素的变化而变化，而且每一个微生物类群、属、种都有自己特定的数值范围。一般细菌DNA中的G+C的摩尔分数范围在25％一75％，放线菌在37％一51％，变化范围很窄。亲缘关系越近，两者之间的G+C曲摩尔分数数值越接近，相反则差异越大。两者的差异超过10％可肯定不是同峰种。 DNA-rRNA杂交：DNA-rRNA杂交的原理方法同DNA-DNA杂交。但DNA-rRNA杂交结果的判断用Tm(e)和RNA结合数表示。Tm(e)为DNA与rRNA杂交解链一半时所需要的温度。RNA结合数是表示100微克DNA所结合的rRNA微克的数，根据这个参数可作出RNA相似性图谱o 3. 微生物命名的几点补充 由于自然中的微生物种类太多，有时会发生同物异名或同名异物的现象，为了避免混乱和误解，常需要在种名之后附有定名人的姓。 由于各分类学家的观点不同，有时对一个种列入哪个属也有不同的看法，往往发生种转属的问题。 种名后括弧内的姓，是表示这个种首先由Krainsky氏定的名，在括弧后再附加改定此菌学名人的姓。 白孢放线菌 Actinomyces albos poreus Krainsky 白孢链霉菌 Streptomyces albos poreus (Krainsky) Waksmaset 有时只泛指某一属的微生物，而不是指定某一个具体的种，或没有种名，只有属名时，可在属名后加sp.或spp.(Species的缩写sp.表示单数；spp.表示复数) Micrococcus sp. 一种微球菌 Micrococcus spp. 一些微球菌 Streptomyces sp. 一种链霉菌 Streptomyces spp. 一些链霉菌 表示亚种的学名，是在种名后加上亚种名称，并在亚种名称之前加subsp.。 有时为了避免混淆，还应该标注上命名人的姓名、命名年份和菌株编号 枯草芽孢杆菌黑色亚种 Bacillus subtilis subsp.niger Staphylococcus aureus Rosenbach 1884 Bacillus subtilis BF7658 Bacillus subtilis ASI.398 4. 新名称的发表 根据细菌命名法规的规定，有效发表的细菌名称应该在公开发行的刊物上进行，在菌种目录、会议记录、会议论文摘要均视为无效记录。 发表新名称时应该在新名称之后加上所属的新分类等级的缩写词。新目ord.nov.,新属gen.nov.,新种sp.nov. Pyrococcus furiosus sp.nov. 若新名称是在国际系统细菌学杂志（IJSB）以外的其他杂志发表的，要取得国际的承认和学名优先权，还必须经过新名称的合法化发表，即将有效发表的英文附件送交IJSB审查，被认为合格后在该杂志上定期公布，命名日期从公