细菌学教学课件 第二章 细菌的分类形态和进化.pptVIP

细菌的分类、形态和进化 吴震州 naturepower@nankai.edu.cn 引起肺炎的病原体 细菌 肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、甲型溶血性链球菌、肺炎克雷白杆菌、 流感嗜血杆菌、变形杆菌、铜绿假单胞菌、肠杆菌属一些细菌、变形杆 菌、军团菌、棒状杆菌、梭状杆菌等 病毒 腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒、副流感病毒、麻疹病毒、巨细胞 病毒、单纯疱疹病毒、汉坦病毒、禽流感病毒、尼巴病毒、冠状病毒等 支原体 肺炎支原体 衣原体 肺炎衣原体、鹦鹉热衣原体 真菌 白色念珠菌、曲菌、放线菌等 其它 立克次体（Q热立克次体等）、弓形虫（鼠弓形虫等)、原虫（卡氏肺孢 子虫等）、寄生虫类（肺包虫、肺吸虫、肺血吸虫等） SARS病原体的发现与确证 2002年11月，广东出现SARS病人 2003年3月15日，WHO组织国际研究网络实验室 3月18日－20日，观察到副粘病毒颗粒以及获得相关序列 3月21日，猴肾细胞培养获得病毒分离物，并排除甲乙型流感病毒病毒、、呼吸道合胞病毒、副流感病毒1、2、3型、腺病毒、鼻病毒、肠道病毒、人间质肺炎病毒等，报告发现衣原体颗粒 3月22日，发现冠状病毒样颗粒 3月23日，明确发现冠状病毒颗粒和核酸片段，开始灵长类动物实验 3月24－4月11日，获得更多的SARS病毒分离物、核酸片段序列，抗体检测 4月12日、14日，SARS冠状病毒的全基因组序列公布 4月16日，WHO宣布确认一种变异冠状病毒引起SARS 4月17日，利用动物实验按科赫原则确定SARS病原体－SARS coronavirus “SARS的研究速度令人惊讶。由于全世界各国实验室之间非同寻常的合作，我们现在肯定地知道谁是SARS的元凶。” （WHO传染病规划执行主任David Heymann 博士） 嗜高温菌 霍乱弧菌 细菌分类的意义 解决两个问题，一是鉴定，即这个细菌是什么；从进化论的角度描述细菌彼此间的演化、进化关系，谁更古老一些，细菌的从属关系等等，这一方法主要是用于解决第二个方面的问题。准确的细菌分类对深入了解不同种属间细菌的功能差异和抗菌新药的研发具有重要的指导意义。 微生物分类学的发展 经典分类学：按微生物表型分类 微生物系统学：按亲缘关系和进化规律分类 发展 表型特征：形态学、生理生化学、生态学等，推断微生物的系统发育。 表型特征结合分子水平上比较微生物的基因型特征（如16S rDNA)探讨微生物进化、系统发育和分类鉴定。 ★微生物分类学的三个任务：分类、鉴定及命名 ☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。 ☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过程。 ☆命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称。 5界论 6界论 8界论 三域学说 系统分类学Phylogenetic Classification 系统建立于演化关系上，而不是表型的相似性 缺少好的化石记录，对于证明原核生物和其他微生物是很困难 直接比较遗传物质和基因产物RNA或蛋白质 分类学依据 经典(传统)特性Classical Characteristics 分子特性Molecular Characteristics 传统特性 形态特性Morphological Characteristics 形态学容易研究和分析 形态比较很有价值，因為构造特征由许多基因所表达，形态相似性常常是系统发育关系密切 光学显微镜、穿透式和扫描式电子显微镜 生理和代谢特性 Physiological and Metabolic Characteristics 生理和代谢特性直接和微生物酵素和转运蛋白的本质和活性有关 蛋白是基因产物，分析这些特性可以提供微生物基因间的间接比较 细菌生理学检查法 －－糖酵解试验 不同微生物分解利用糖类的能力有很大差异，或能利用或不能利用，能利用者，或产气或不产气。可用指示剂及发酵管检验。 LET肉汤管或BGLB是否产气？ Biolog微生物鉴定系统 生态特性Ecological Characteristics 自然界中的生态特性影响微生物与其环境关系 生命循环类型，天然共生关系，对特定宿主致病能力，和棲息地喜好之要求，如温度、pH、氧气和渗透浓度 遗传分析Genetic Analysis 经由转化作用transformation和接合作用conjugation交换染色体基因 转化作用可在不同原核生物『种』间发生，但在『属』间则非常