安徽黄山地区肠道病毒71型的基因特征分析.docVIP

精品论文 参考文献 安徽黄山地区肠道病毒71型的基因特征分析 程鹏 程韶光 　　（黄山市疾病控制与预防中心 安徽黄山 243000） 　　【摘要】目的：了解2012-2013年黄山地区流行的肠道病毒71型（EV71）基因型情况。方法：利用RT-nPCR检测两年43份临床诊断为手足口病患儿的咽拭子标本。结果：43份标本中检测到13份阳性EV71 RNA，检出率为30.23%；经过测序证实13份标本均为EV71 C4型。结论：黄山地区2012-2013年手足口病主要由C4型 EV71病毒引起且存在很高的同源性。 　　【关键词】肠道病毒71型 手足口病 基因型 同源性 　　【中图分类号】R39 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752（2014）16-0049-03 　　The analysis of genic characteristics of Enterovirus 71 in Huangshan Area 　　 Cheng Peng,Cheng Shaoguang 　　 (Huangshan Center for Disease Control and Prevention, Huangshan 243000,China) 　　【Abstact】 Objective In order to investigate the EV71 genotypes in Huangshan area. Methods EV71 RNA was detected in 43 HFMD samples from the hospitals by reverse translation polymerase chain reaction(RT- nPCR). Result There are 13 positive products, positive rate is 30.23%；After the 13 positive products were sequenced, the results show them all C4 genotype EV71. Conclusion It seems that the HFMD children are mainly infected by the C4 genotype EV71 in this area and the current C genotype EV71 did not varied significantly in the city. 　　【Key Word】 EV71 Hand-foot-mouth disease Genotype Homogeneous 　　人类肠道病毒71 型(EV71)属于肠病毒属A型，是引起手足口病(Hand, foot and mouth disease, HFMD)主要病原体之一，临床症状有疱疹性咽峡炎、无菌性脑膜炎及脑炎等。EV71相比于其他手足口病的病原最大的一点区别，是其急性感染易造成严重的神经系统疾病，可引起10%-25%患儿死亡 [1]。 2008年安徽省阜阳市发生儿童感染EV71疫情，死亡总人数达到36人[2]。 　　学者利用VP1序列的差异对EV71进行分子流行病学研究发现[2]，EV71可分为A、B、C三个型。各地流行的EV71病毒株存在差异，美国、澳大利亚、以及南美洲流行的毒株为A和B型毒株，1997年以后亚太地区开始EV71的流行，主要为C型[3]，而2008年安徽省阜阳市流行的毒株则为C4亚型。 　　为了解皖南山区EV71流行毒株的基因型别，我们对2012-2013年黄山地区43例手足口病疑似患儿的咽拭子标本进行EV71 RNA检测，对其中的13份RT-nPCR阳性产物进行测序，并与已知的基因型以及亚型代表株进行序列比对，发现本地区EV71感染虽然均为EV71 C4型引起，但不同毒株之间存在一定的变异。 　　1 材料与方法 　　1.1 EV71代表株和序列 　　从GenBank中获取8株EV71的VP1核苷酸序列，其中2株EV71为全基因序列，6株为EV71部分基因序列，包括A、B、C型。 　　1.2 临床标本来源 　　根据卫生部发布的《手足口病预防控制指南》(2008年版),收集2012年7月至2013年9月安徽黄山地区收治的临床诊断为手足口病患儿的咽拭子标本共43份。 　　1.3 引物的设计 　　根据GenBank中已知的EV71核苷酸序列，利用不同的基因型以及亚型的保守区合成的一组通用性引物，引物序列为：第一轮:5rsquo;-GTTCTTAACTCACATAGCA-3rsquo