不同盐湖、盐田之间嗜盐古菌多样性比较-遗传学专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 摘 要 盐湖、盐场以及土壤中蕴藏着丰富的嗜盐微生物资源，嗜盐古菌目前具有重 要的研究价值，本文对陕西定边苟池、花马池以及连云港盐田三个盐环境中嗜盐 古菌多样性进行了研究。采用分离培养技术分别从三个地区分离纯化得到 16 个嗜 盐古菌菌株，通过 PCR 扩增菌株的 16S rDNA 基因进行测序分析，具体结果为从 苟池分离纯化得到的 4 株嗜盐古菌，属于盐红菌属(Halorubrum)；从花马池分离得 到的 2 株分别属于盐盒菌属(Haloarcula)和盐红菌属(Halorubrum)；从连云港分离纯 化得到的 10 株菌，1 株属于盐盒菌属(Haloarcula)，9 株为盐红菌属(Halorubrum)。 三个地区所有分离得到的菌株中，盐红菌属（Halorubrum）为优势菌属，占比 87.5%。 盐盒菌属（Haloarcula） 在连云港盐场和花马池样品中占比在 12.5%左右。表明三 个地区嗜盐古菌的种群分布既具有相似性和又有各自的独特性,这可能与环境温 度、盐含量、酸碱性等有关。16S rDNA 基因序列系统发育分析仅仅是测定微生物 物种资源多样性的一个分类方法，如果想获得更详细、精确的分类信息，还需要 进一步的分类研究。 采用非培养技术进一步对连云港地区盐水环境嗜盐古菌多样性进行研究。高 通量测序结果表明，从环境样品中总共获得 6126 条有效序列，经过去杂优化最终 获得 4895 条序列用于后续的生物信息学分析。古菌的序列平均长度 488bp，古菌 文库中有 535 个 OTUs。当遗传距离为 0.03 时，古菌的 Chao1 物种总数、ACE 指 数、Shannon 多样性指数分别为 764、834、4.76；样品中古菌均属于盐杆菌科 (Halobacteriacea)，共分为 14 个属：盐红菌属(Halorubrum) 53.56%、盐微菌属 (Halomicrobium) 0.17% 、盐盒菌属 (Haloarcula) 2.32% 、盐盘菌属 (Haloplanus) 5.32% 、盐棍菌属 (Halorhabdus) 0.54% 、盐碱单胞菌属 (Natronomonas) 1.1% 、 Halonotius 22.22%、Halogranum 0.03%、Natronoarchaeum 0.11%、Halolamina 0.17%、 Halobellus 4.86%以及未分类的盐杆菌属 1.79%，其中盐红菌属(Halorubrum)和 Halonotius 为优势菌属。 通过传统的 16S rDNA 系统发育分析，发现所测的连云港灌西盐田样品中优势 菌属为 Halorubrum 和 Haloarcula，而高通量测序结果表明 Halorubrum、Halonotius 为优势菌属。同时还有 Halogranum、Natronoarchaeum、Haloarcula 以及一些尚未 I 分类的菌属存在。这说明高通量测序对于环境微生物的分类鉴定更为详细，分类 结果更准确。 关键词：嗜盐古菌；16S rDNA 序列；系统发育分析；454 高通量测序 II Abstract Hypersaline is rich in halophilic microorganisms resources, and Halophilic archaea have an important value in researching. In this paper, microorganisms were isolated from Gouchi, Huamachi and Lianyungang salt field. Then the studies had been conducted on archaea’s diversity after cultured. With 16S rDNA sequencing and phylogenetic analysis, it showed that four strains isolated and purified from Gouchi belonging to the genus of Halorubrum ; two strains isolated from Huamachi belonging to the genus Haloarcula and Halorubrum; ten strains isolated and purified from Lianyungang belonging to the genus Haloarcula and Halorubrum. Three regional populations showe