黑素皮质素受体4基因在5个地方鸡种中遗传多态性分析.docVIP

黑素皮质素受体4基因在5个地方鸡种中遗传多态性分析 　　摘要：本试验采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析了黑素皮质素受体4（MC4R）基因在5个地方鸡种中的遗传多态性，结果在5个供试鸡群体中检测到两个突变位点。在NC_006089.4：g.54 CG位点中，CC基因型在莱芜黑鸡和琅琊鸡中均没有检测到，CG杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型，突变型GG基因型在其余4个群体中表现为优势基因型，等位基因G在所有供试群体中表现为优势等位基因。在NC_006089.4：g.315位点中，GT杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型，GG野生型在其余4个群体中表现为优势基因型，等位基因G在除汶上芦花鸡以外的4个群体中表现为优势等位基因。 　　关键词：鸡；MC4R基因；PCR-SSCP；PCR-RFLP；遗传多态性 　　中图分类号：S831.2 文献标识号：A 文章编号：1001-4942（2017）08-0127-04 　　Abstract The SNPs of MC4R gene in five Chinese indigenous Chicken Breeds were detected by PCR-SSCP and PCR-RFLP methods. As a result， two mutations in MC4R gene were identified. In NC_006089.4：g.54 CG， genotype CC was not found in Laiwu Black chickens and Langya chickens， the frequency of genotype CG was higher than that of the other genotypes in Wenshang Barred chickens， and GG showed to be the advantageous genotype in the other four populations； allele G was dominant in all the five populations. In NC_006089.4： g.315， heterozygous genotype GT was advantageous in Wenshang Barred chickens， and GG was advantageous in other four populations； allele G was dominant in the four populations except Wenshang Barred chickens. 　　Keywords Chicken； MC4R gene； PCR-SSCP； PCR-RFLP； Genetic polymorphism 　　黑素皮质素受体4（melanocortin-4 receptor，MC4R）基因属于黑素皮质素受体家族，为G蛋白耦联受体超家族的一员。目前，人们已经在5个物种（人、猪、鼠、鸡和牛）中分离并克隆出所有的MCRs亚型[1]。已有研究表明，MC4R主要在控制体重、采食量和能量稳态的过程中发挥重要作用[2，3]。MC4R基因多个单碱基突变已被认为与人类肥胖病症关系密切[4-7]； MC4R-/-小鼠表现为极度肥胖[8]；猪MC4R基因被认为是影响生长肥育性状的主效基因之一[9]；中国西门塔尔牛MC4R基因表达量也被认为与背膘厚度呈显著相关[10]。 　　鸡MC4R基因被定位在2号染色体的2q12处，由长996 bp的单一外显子构成，编码332个氨基酸，在肾上腺、性腺、脾、脂肪等组织中广泛表达[11]。目前鸡MC4R基因的相关研究结果表明，MC4R基因对鸡生长和体组成性状有显著影响[12，13]，但对鸡脂肪性状的影响还未有定论。我国地方鸡品种资源非常丰富，以肉质鲜美而闻名，本研究采用PCR-SSCP技术和PCR-RFLP技术检测MC4R基因在我国地方鸡种中的遗传多样性，以期为我国地方鸡种的创新利用提供科学资料和理论依??。 　　1 材料与方法 　　1.1 试验材料 　　5个地方鸡种汶上芦花鸡（WL）、济宁百日鸡（JB）、莱芜黑鸡（LH）、琅琊鸡（LY） 和石岐杂鸡（SQZ）均来自山东省地方鸡品种资源活体基因库，饲养全阶段由专人管理，营养水平一致。每品种随机抽取30只个体，公母各半，翅静脉采血，EDTA抗凝，酚/氯仿抽提基因组DNA。-20℃保存备用。 　　1.2 引物设计 　　根据鸡MC4R基因DNA序列（GenBank号： NC_006089.4），采用Primer Premier 5.0和Oligo 6软件设计P3引物，