草鱼生长性状和抗病力遗传参数及QTL初步定位分析-水产养殖专业论文.docxVIP

万方数据 万方数据 上海海洋大学硕士学位论文 答辩委员会成员名单 姓名 工作单位 职称 备注 王群 华东师范大学 教授 主席 汪桂玲 上海海洋大学 副教授 委员 白志毅 上海海洋大学 副教授 委员 牛东红 上海海洋大学 副教授 秘书 答辩地点 水产与生命学院 C217 答辩日期 2015.6.4 上海海 上海海洋大学硕士学位论文 草鱼生长性状和抗病力遗传参数及 QTL 初步定位分析 摘 要 草鱼为我国主要的淡水养殖鱼类，但其种质资源随着大规模的人工养殖在逐渐 退化，因此对草鱼进行有计划、科学的人工选育是非常必要的，本研究对草鱼的生 长和抗病的相关遗传参数进行基础研究分析，通过对草鱼一龄前不同生长阶段性 状之间的相关性分析、4 月龄草鱼生长性状及抗病力的遗传力研究、LEAP-2 基因 的 SNPs 与草鱼生长和抗病力的关联分析以及草鱼生长和抗病力的初步 QTL 定位分 析。以期为草鱼的育种研究提供基础数据。研究的结果如下： 1.草鱼一龄前不同月龄主要形态性状对体质量的影响效果 对 2 月龄，4 月龄，6 月龄，12 月龄的草鱼主要形态性状包括体质量、体长、 体高和体宽进行连续测量。采用相关分析，通径分析和多元回归分析计算获得各性 状与体质量的相关系数、通径系数和决定系数参数。相关分析结果显示草鱼各月龄 主要形态性状均与体质量呈现极显著的相关(P＜0.01)。通径分析结果显示 2 月龄 体高对体质量直接作用最大，体宽对体质量的间接作用最大；4 月龄体长对体质量 直接影响最大，体宽对体质量的间接作用最大；6 月龄体高对体质量直接作用最大， 体宽对体质量的间接作用最大；12 月龄体长对体质量直接作用最大，体宽对体质 量的间接作用最大；同时决定程度分析结果与通径分析结果是一致的。偏回归系数 显著性检验结果表明体长，体高和体宽均可引入并建立以体长、体高、体宽为自变 量，体质量为因变量的回归方程。各月龄研究结果表明草鱼不同生长阶段影响体质 量的主要性状不尽相同，2 月龄和 6 月龄对体质量影响最大的性状为体高，4 月龄 和 12 月龄对体质量影响最大的性状为体长。4 月龄和 12 月龄的调整决定系数 R2 大 于 0.85，表明 4 月龄和 12 月龄影响体质量的主要性状确定为体长。 2. 4 月龄草鱼生长性状和抗病力遗传参数估计及家系对比分析 对 4 月龄草鱼的混合家系，进行亲子鉴定，确定家系信息，利用生长数据和家 系信息对 4 月龄草鱼生长性状和抗病力的遗传参数进行估计，同时对不同家系的 生长和抗病性进行对比。本研究通过 8 对微卫星对 1047 个个体进行亲子鉴定，使 用 Genemapper Version 4.0 软件读取微卫星 STR 分型数据，利用 Cervus 3.0 软 件对 1047 个子代个体进行亲权鉴定回建家系，结果为 972 个个体确定了其父本信 I 息，确定率达到 92.84%。根据亲子鉴定的结果获得了来自 22 个母本和 23 个父本 的 237 个全同胞家系，其中 92 个全同胞家系包含了 779 个子代个体，每个家系的 子代个体数在 3-89 之间。4 月龄草鱼的体质量的遗传力为 0.3464，体长的遗传力 为 0.3313，体高的遗传力为 0.3045，体宽的遗传力为 0.3033 和抗病存活时间的 遗传力为 0.0597。因此 4 月龄草鱼的体质量、体长、体高和体宽的均大于 0.3 为 高遗传力，均可以稳定的遗传给下一代；4 月龄草鱼抗病存活时间的遗传力小于 0.15 为 0.0597，属于低遗传力。4 月龄草鱼的体长与体质量的遗传相关和表型相 关最大分别为 0.9856 和 0.9766，而体长与存活时间的遗传相关和表型相关分别为 0.3482 和 0.3463。性状间的遗传相关系数是制定目标性状的重要依据，对于抗病 存活时间的遗传力为低等遗传力水平，因此在对抗病性能进行选育时可以通过对 体长的间接选育或分子标记来辅助育种来达到育种的目标。同时生长性能好的家 系和存活时间长以及存活率高的家系是有交叉的，主要是 48 号家系和 54 号家系， 这两个家系的父母本分别为 F97832 和 M51696、F51566 和 M97893，同时生长性能 指标较低的家系也存在交叉为 72 号和 84 号家系，这两个家系的父母本分别为 F51593 和 M51341、F97808 和 M97846。因此对亲本的合理选择和淘汰为草鱼良种 抗病群体的建立提供一个新的方法。 3.草鱼 LEAP-2 基因全序列 SNPs 与生长及抗病性能的关联性分析 对草鱼 LEAP-2 基因全序列 SNPs 与生长及抗病性能的相关性进行