代谢组学的研究对象主要是分子量小于1000D.pdf

1. 代谢组学主要的研究对象及研究目标有哪些？ 答： 代谢组学的研究对象主要是分子量小于1000Da 的内源性小分子，研究方向包括：全代 谢组研究（对限定条件下的特定生物样品中所有代谢组分的定性和定量），靶向代谢组研究 （对某个或某几个特定组分的分析），代谢轮廓分析（对少数所预设的一些代谢产物的定量 分析），代谢指纹图谱分析（不分离鉴定具体单一组分，而是对样品进行快速分类），其中全 代谢组和靶向代谢组研究是目前代谢组研究的主要方向。 2. 代谢组研究相对于基因组和蛋白质组研究而言有什么不同之处？ 答： 主要特点包括三方面： 基因和蛋白表达的有效的微小变化会在代谢物上得到放大，从而使检测更容易； 代谢组学的技术不需建立全基因组测序及大量表达序列数据库； 因为代谢产物在各个生物体系中都是类似的，所以代谢组学研究中采用的技术更通用。 3. 代谢组的样品重复性有什么要求？ 答： 代谢组学基于多元统计分析方法进行的，在样品准备上相对于转录组和蛋白质组而言 需要更多的重复数据。 一般建议植物样品：最少6 次，建议8 次生物学重复。 模式动物及微生物样品：最少8 次，建议10 次生物学重复。 临床样品：30 次生物学重复以上，如组织样品不好取样，可控制在20 次重复以上。 4. 代谢组学在系统生物学中有什么作用？地位如何？ 答： 基于组学技术的系统生物学研究内容涵盖基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组 学。这几种组学的研究中，基因组学主要研究生物系统的基因结构组成，蛋白质组学研究有 生物系统表达的蛋白质及由外部刺激引起的差异。 系统生物学中，基因组学和蛋白质组学和告诉你可能发生什么，而代谢组学则告诉你 已经发生了什么。 代谢物作为生物体表型的基础能够帮助我们更直观有效地了解生命现象揭示生命本质。 代谢组学本质上是指从整体上研究生物体的代谢物，是对某一生物、组织或细胞中的所有低 分子量代谢产物进行定性与定量分析的一门科学。 代谢组学以指标分析为基础，高通量检测为手段，通过研究生物体内代谢物的种类与 数量及其变化规律来阐述机体在正常生命状态及环境变化后的代谢过程。代谢组是系统生物 学的分支学科之一。 目前，其研究内容主要包括对代谢物进行定性或定量分析，不同基因型的生物体进行 代谢组学表型研究，不同生长环境及加物理、化学或生物性刺激后个体代谢产物的应答，进 行代谢途径或代谢网络解析与转基因评价。 5. 动植物组织，细胞，血液，尿液等样本一般能搜到多少种代谢物？ 答：代谢物在不同的样品中，种类各异，一般植物（20 万种）、动物（2500 种）、微生物（1500 种）。在GC-MS 平台：血液400 左右，尿液600 左右，动植物组织或细胞在500 到1000+不 等，与生物种类有关；LC-MS 平台可以检测到的物质峰可以达到几千甚至上万，但是由于数 据库的限制，目前都是做完差异分析后再做定性，一般禅意代谢物会控制在200 个左右）。 6. 代谢组和毒理学的关系？ 答： 毒理学是一门研究外源因素（化学、物理、生物因素）对生物系统的有害作用的应用 学科。是一门研究化学物质对生物体的毒性反应、严重程度、发生频率和毒性作用机制的科 学，可以对毒性作用进行定性和定量评价。 代谢组学以指标分析为基础，高通量检测为手段，通过研究生物体内代谢物的种类与 数量及其变化规律来阐述机体在正常生命状态及环境变化后的代谢过程。代谢组研究内容之 一是不同生长环境及加物理、化学或生物性刺激后生物体代谢产物的应答，代谢途径或代谢 网络的解析。 动物的毒害与植物的毒害，植物的生物胁迫（病虫害）与非生物胁迫（旱、盐、冷、 热、紫外、重金属等）都会对生物体产生刺激。因此毒理学可以作为代谢组学研究的手段， 而代谢组学研究可以为毒理学研究基础的阐述提供参考，两者相辅相成，以研究生物体代谢 机制。 7. 目前的主要代谢组技术有哪些？各有什么特点？ 答： 目前主要的代谢组技术平台主要有NMR （核磁共振）、GC-MS （气相色谱-质谱）、LC-MS （液相色谱-质谱）。 NMR 技术具有无损伤性，无辐射性，无偏向性，方法灵活，处理简单等优点，但灵敏 度较低，动态范围有限； GC-MS 技术具有高分辨率，高灵敏度，有比较标准的数据库，易于定性等优点，但需 衍生化，预处理繁琐； LC-MS 技术具有灵敏度较高，较宽动态范围，无需衍生化等优点，但标准谱图库信息 不全，不易定性； 8. 应该如何选择实验平台？ 答： 代谢物分布广，性质差异