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用实例演示最大简约法构建系统发生树 生技第五组 蔡苑颖 陈晓兰 陈观芝 张满桥 张明红 陆丽平 系统进化树：用来表示被认为具有共同祖先 的各物种间演化关系的树。是一种亲缘分支分类方法。在树中，每个节点代表其各分支的最近共同祖先，而节点间的线段长度对应演化距离（如估计的演化时间等） 最大简约法：根据信息位点提供的个序列间的替换情况，在所有可能的树中找出替换数最小的树的方法。 信息位点：指能把所有可能的树区别出来的位点，即核苷酸序列存在差异的点 步骤：序列比对 写出所有可能的树 分析信息位点 将每棵树信息位点 上的字符替换数相加，找出总替换数最小的树 举例：已知d1、d2、d3、d4是4个物种的DNA序列，用最大简约法构建进化树 d1：AAC d2：AAT d3：GGC d4：GGT 多序列比对 d1：A A C d2：A A T d3：G G C d4：G G T 写出所有可能的树，有三种 d1 d3 树1 d2 d4 d1 d2 树2 d3 d4 d1 d2 树3 d4 d3 分析信息位点，由?可看出3列核苷酸序列都有差异，所以都是信息位点 第一列各碱基在3种进化树的替换情况如下：P246 d1 A d3 G 树1 A G d2 A d4 G d1 A d2 A 树2 G G d3 G d4 G d1 A d2 A 树3 G G d4 G d3 G 第2列与第1列情况一样 第3列各碱基在3种进化树中的替换情况如下：P247 d1 C d3 C 树1 T T d2 T d4 T d1 C d2 T 树2 C T d3 C d4 T d1 C d2 T 树3 T T d4 T d3 C 找出替换总数最小的数 因为树1的替换总数最小，因此取树1作为这4个序列的进化树 THANKS！ * 树1 树2 树3 第1列替换数 1 2 2 第2列替换数 1 2 2 第3列替换数 2
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