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溶液 pH 值与蛋白质等电点的关系 电泳 ? 带电粒子在电场中移动的现象称为 电泳 . ( electrophoresis ) 。 Whats electrophoresis? 某蛋白质 pI=3.5 ,电泳缓冲 液 pH=5.0 ,通电后该蛋白质向正 极还是负极移动? 二、蛋白质的胶体性质 蛋白质是高分子化合物,直径为 1~100nm 。 1 、亲水胶体稳定因素: 1 )、蛋白质表面的 水化膜 2 )、 电荷的排斥 作用 * 两分子氨基酸缩合形成 二肽 ,三分子氨 基酸缩合则形成 三肽 …… * 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基 团不全,被称为 氨基酸残基 (residue) 。 * 由 10 个以内 氨基酸相连而成的肽称为 寡肽 (oligopeptide) ,由 50 个以内 的氨基酸相 连形成的肽称 多肽 (polypeptide) 。 N 末端: 多肽链中有 自由氨基 的一端 C 末端: 多肽链中有 自由羧基 的一端 多肽链有两端 * 多肽链 (polypeptide chain) 是指许多 氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。 读写方向: N C 肽链结构 ㈡ 生物活性肽 谷胱甘肽 ( glutathione , GSH) N 端 C 端 蛋白质的分子结构包括 : 一级结构 (primary structure) 二级结构 (secondary structure) 三级结构 (tertiary structure) 四级结构 (quaternary structure) 空间 结构 蛋白质的分子结构 The Molecular Structure of Protein 蛋白质分子的结构层次 Lys Gly Leu Val Ala His Amino acids Lys Ala Arg Met Glu Leu 肽键 (三)蛋白质的一级结构 primary structure ? 定义 蛋白质分子中 氨基酸的排列顺序 。 ? 化学键 肽键 ,有些蛋白质还包括二硫键。 N 末端 C 末端 牛核糖核酸酶的一级结构 病例:镰型红细胞贫血 蛋白质的空间结 构以一级结构为 基础。 蛋白质一级结构 改变,其空间结 构易改变! 影响着蛋白质的 生理功能! 镰形红细胞贫血病因 N-val · his · leu · thr · pro · glu · glu · · · C(146) HbS β 肽链 HbA β 肽 链 N-val · his · leu · thr · pro · val · glu · · · C(146) 这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病, 称为“分子病”。 多肽链的氨基酸序列分析 1. 测序前的准备 N 端分析以确定蛋白质的多肽链数目 断裂二硫键 分离单一多肽链 测定多肽链的氨基酸组成 2. 多肽链氨基末端与羧基末端分析 二硝基氟苯( 1-fluoro-2,4-dinitrobenzene )法 丹酰氯 (dansyl chloride) 法 3. 多肽链的氨基酸序列测定和重叠组合 对多肽链进行限制性水解成小片段 Edman 降解法进行小片段肽段的序列分析 对各片段序列进行比较叠加,拼出完整的多肽序列 蛋白质肽链的局部空间结构,即各段肽 链 主链原子的空间分布状态 ,并不涉及氨基 酸残基侧链的构象。 ? 定义 ? 化学键: 氢键 ㈠ 蛋白质的二级结构 secondary structure 二、蛋白质的空间结构 肽链结构 主链 侧链 侧链 侧链 侧链 1 .形成二级结构的基础 肽单元 (peptide unit) : 肽键中的 C 、 O 、 N 、 H 四个原子和相邻 的两个 α 碳原子处在同一个平面上 。 2. 蛋白质二级结构的主要构象 ? ? - 螺旋 ( ? -helix ) ? ? - 折叠 ( ? -pleated sheet ) ? ? - 转角 ( ? -turn ) ? 无规卷曲 ( random coil ) ( 1 ) ? - 螺旋 ( ? -helix) 氢键 氢键 ( 2 ) ? - 折叠 ( ? -pleated sheet ) 氢键 ( 3 ) ? - 转角 和 无规卷曲 ? - 转角 无规卷曲 是用来阐述 没有确定规律性 的那部 分肽链结构。 氢键 核糖核酸酶分子中的二级结构 α - 螺旋 β - 折叠 β - 转角 无规卷曲 ㈡ 蛋白质的三级结构 疏水作用力 、 离子键、氢键 和 范德华力 等。 ? 化学键 整条肽链中 所有原子 在三维空间的排布位置。 ? 定义 蛋白质的三级结构 稳定和维系蛋白质三级结构的化学键 离子键 离子键 氢键 氢键 疏水作用力 疏水作用力 范德华力 范德华力
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