B40团簇与四种DNA碱基分子相互作用的理论研究.pdfVIP

摘 要 二十一世纪，是纳米技术和生物技术飞速发展的时代。越来越多的纳米材料被应 用于生物领域解决众多棘手的生命科学问题。比如碳纳米管、石墨烯、富勒烯等纳米 材料都被广泛用作生物分子（如蛋白质、氨基酸、核酸、特别是DNA 碱基分子）的 吸附剂和传感器，来达到吸附和检测生物分子的目的。B40 团簇自2014 年发现以来， 就被广泛应用于气体传感器，但在生物分子领域的应用至今还寥寥无几。 本文运用密度泛函理论（DFT ）在GGA-PBE-D3 水平下，分别研究了B40 与鸟嘌 呤（G ）、腺嘌呤（A ）、胞嘧啶（C ）、胸腺嘧啶（T ）四种碱基分子之间的相互作 用。首先在同一基组水平下分别对 B40 、四种碱基以及 B40-X （X=G 、A 、C、T ）体 系进行结构优化，得到能量最低的稳定结构。在稳定结构基础上对结构参数、分子静 电势、吸附能、电荷转移、态密度图、能隙及电导率进行分析，以探究B40 团簇与四 种碱基分子之间是否存在相互作用，存在何种相互作用。 本文研究结果如下：（1）较大的吸附能和电荷转移表明 B40 与四种碱基之间均 存在化学吸附作用，B40 可作为四种碱基的吸附剂，并且 B40 团簇对四种碱基分子的 吸附能力远远大于单壁碳纳米管的吸附能力；（2 ）能隙和电导率的显著变化表明B40 可检测到四种碱基，有望作为生物传感器的有效器件；（3 ）B40 与 A 碱基相互作用 时吸附能和电荷转移均最大，表明B40 对A 碱基的吸附能力最强；（4 ）四种碱基中 电导率改变量最大的为G 碱基，所以B40 对G 碱基的检测灵敏度远远高于其它碱基。 最后期望本理论工作可以为B40 团簇的应用开辟一个新的方向，为基于硼纳米材 料的DNA 碱基分子的吸附或检测提供理论基础与理论指导。 关键词：密度泛函理论；B40 团簇；DNA 碱基；生物传感器 I Abstract The 21st century is an era of rapid development of nanotechnology and biotechnology. More and more nanomaterials were being used in the biological field to solve many difficult bioscience problems. For example, carbon nanotubes, graphene, fullerenes and other nanomaterials were widely used as adsorbents and sensors for biological molecules (such as proteins, amino acids, nucleic acids, especially DNA bases molecule) to adsorb or detect the biological molecules. B40 cluster had been widely used in gas sensor since its discovery in 2014, but had not been widely used in the field of biomolecule. In this paper ，the adsorption of guanine (G), adenine (A), cytosine (C) and thymine (T) base on B40 were investigated with density functional theory (DFT) at GGA-PBE-D3 level. Firstly, the structure of B40 cluster, four bases and B40