山药-黄芪药对治疗2型糖尿病性骨质疏松的网络药理学机制研究.docxVIP

山药-黄芪药对治疗2型糖尿病性骨质疏松的网络药理学机制研究 摘要：目的 筛选山药-黄芪药对的化学成分并预测其作用靶点，建立药物活性成分-作用靶点-信号通路网络，分析山药-黄芪药对治疗2型糖尿病性骨质疏松(type 2 diabetic osteoporosis,T2DOP)的作用机制。方法 通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)检索山药、黄芪的所有潜在活性成分及其对应的作用靶点，通过Gene Cards和OMIM数据库检索2型糖尿病性骨质疏松的相关靶基因，构建山药、黄芪“化学成分-候选靶标-T2DOP相关靶标”网络，筛选节点并对节点中的靶标进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。最终利用Cytoscape软件绘制“化学成分-关键作用靶点-信号通路”网络。结果 筛选得到活性化合物36个，其中山药16个、黄芪20个，共涉及698个靶点，T2DOP直接相关靶基因3 305个;筛选节点40个，其中31个为T2DOP相关靶基因。这些基因主要涉及56个生物学过程，21个分子功能，10个细胞组分条目，作用于17条信号通路中的关键靶点;山奈酚等13个化合物可能为核心活性分子，CDK2等15个靶标为核心靶标。结论本研究结果初步阐释了山药-黄芪药对治疗T2DOP的物质基础及作用机制，体现了中药多成分、多靶点、多途径的特点，为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。 2型糖尿病性骨质疏松(type 2 diabetic osteoporosis,T2DOP)是糖尿病常见的并发症之一，是一种全身性代谢性骨病。T2DOP的发病率随糖尿病患者群体的不断扩大而逐年升高，而中国糖尿病患者骨质疏松的发病率为40%～66%1材料与方法1.1材料1.1.1“山药-黄芪”药对化学成分:1.1.2 T2DOP疾病相关基因:1.1.3“山药-黄芪”药对的活性成分靶标:1.2方法1.2.1构建“山药黄芪化学成分-山药黄芪候选靶标-T2DOP相关靶标”网络:1.2.2基因功能估计分析:1.2.4“山药黄芪化学成分-关键作用靶点-信号通路”网络的构建:2结果2.1“山药-黄芪”药对中活性组分的筛选2.2 T2DOP疾病靶基因的筛选结果在Gene cards网站收集得到T2DOP疾病靶标共3 180个，OMIM网站收集得到183个T2DOP靶标，合并2个数据库数据，剔除重合基因，共检索出3 305个相关基因信息。2.3“山药-黄芪”药对中活性成分的靶标预测将筛选出的36个成分分别在TCMSP平台和Swiss Target Prediction网站中查询预测的靶点，并通过Uniprot数据库将蛋白靶点转化为靶点基因，其中山药16个成分，370个靶基因;黄芪20个成分，547个靶基因，最终共有36个化合物，去除重复靶基因后共698条靶基因信息。2.4“山药黄芪化学成分-山药黄芪候选靶基因-T2DOP相关靶基因”网络的构建利用Cytoscape 3.7.1软件构建“山药黄芪化学成分-山药黄芪候选靶基因-T2DOP相关靶基因”网络，见图1。网络中各个节点之间相互作用，根据网络拓扑学结构分析结果，共512个节点，以大于该网络的度中心性均值7.286 0、接近中心性0.316 8、中介中心性/中间中心性均值0.004 1为筛选条件筛选出关键节点67个，其中含有靶标40个，MET,CYP19A1,AR,PTGS1,ADORA2A,PTGS2,CDK2,GSK3B,NCOA2,ESR2,KDR,ESR1,PTPN1,SRC,RXRA,EGFR,CASP3,GABRA1,CCNA2,PARP1,CA2,ALOX12,PGR,ADRB2,NOS2,PPARG,SYK,ABL1,MAPK14,CCNB1,BACE1共31个靶标为T2DOP疾病靶基因，此外尚有ACHE、ADORA1、ADRA1B、CA14、CA9、CDK1、CHRM1、HSD17B2、MAOB 9个关键靶标。2.5 GO功能分析结果使用David 6.8数据库对山药黄芪治疗T2DOP的40个关键靶点进行GO富集分析，筛选P0.05的条目，共有87个GO生物学条目，其中有56个BP条目，21个MF条目，10个CC条目，生物过程包括肽基丝氨酸磷酸化、调节细胞增殖、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路、视黄酸的反应、转录、ERK1和ERK2级联的正调控、子宫内胚胎发育、RNA聚合酶II启动子转录的正调控、炎症反应、凋亡过程的负调控等;分子功能涉及ATP结合、锌离子结合、类固醇激素受体活性、序列特异性DNA结合、碳酸盐脱水酶活性等。富集于细胞核、细胞膜、细胞溶质、细胞质核周区域、高尔基体、质膜胞质侧的外源成分、受体复合体、核染色