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分子诊断在感染性疾病中的应用
袁艳军
感染的慨念
口感染是病原体在宿主的个体内进行有害的复制、繁殖过程.
□病原体:细菌、真菌、病毒、支原体、衣原体、螺旋体、寄生虫
□条件致病菌
共生状态在正常情况下,人体的一些腔道和体表均有微生物寄生不同的感染状态
共生状态
在正常情况下,人体的一些腔道和体表均有微生物寄生
不同的感染状态
感染性疾病的分子诊断策略
? 一般性策略(检出病原体的DNA/RNA):
-判断有无感染
-是何种病原体感染
-常用方法:PCR +分子探针杂交
?完整性策略
-检出病原体
-分型(分类)一亚型一耐药性
1=-常用方法:杂交、PCR、基因芯片、DNA测序
1=
感染性疾病的分子诊断临床价值
,分子生物学检验技术在感染性疾病中的应用主要 包括对病原生物进行鉴定、分型、耐药诊断和治 疗过程中的疗效监测等
?动态、定量地检测病原体核酸,能对疗效判断和
病情预后评价提供客观的依据
?目前已经应用于一些重要的感染性疾病,如结核
病、病毒性肝炎、艾滋病、SARS、人禽流感等
-(-)结核分枝杆菌
-(-)肝炎病毒
蜘(三)人类免疫缺陷病毒
-(四)HPV病毒
跡(五)SARS冠状病毒
结核分枝杆菌
结核分枝杆菌(M.tuberculosis)
感染方式
七 呼吸道、消化道或皮肤损伤侵入
机体
所致疾病
疾病种类多样化 以肺结核为主
生物学主要特点:
1 ?结核分枝杆菌细胞壁中含有大量脂质 2?引起的疾病都呈慢性,并伴肉芽肿
3 .抗酸染色阳性
实验室诊断现状
抗酸涂片:灵敏度低,易漏诊 不能区分TB/NTM细菌培养:耗时
抗酸涂片:
灵敏度低,易漏诊 不能区分TB/NTM
细菌培养:
耗时4?8周
C3
菌种解.药敏成佥:
再加4-8
灵敏度,时效性,快速鉴别诊断均无法实现!
分子生物学检测方法
?近年来核酸扩增技术和杂交分析技术的发 展,为分枝杆菌的检测、鉴定和药敏实验 提供了极大的方便,可将诊断时间从几周 降低到几天。
?结核病基因诊断技术主要包括聚合酶链反 应(PCR)、核酸探针杂交、DNA序列测定、 基因芯片、基因分型等。
基因结构
分子诊断
基因组特点
共价封闭环状结构
分枝杆菌分子诊断系统
实时荧光PC R
基因芯片快速检测平台
分枝杆菌核酸检测
分枝杆菌菌种鉴定
结核分枝杆菌耐药基因检测
菌种鉴定
菌种鉴定
MDR早期诊断
PAGE
PAGE #
分枝杆菌核酸检测
功能:TB快速筛查;TB/NTM鉴别诊断
A高效: f 样本可同时检测结核分枝杆菌和NTM
A快速:4周(菌培)T小时
?灵敏:10个菌/反应(TB ) ; 102个菌/反应(NTM )
分枝杆菌菌种鉴定(DNA微阵列芯片法)
检测范:结核、胞内、鸟、戈登、堪萨斯、偶然、痙痂、浅黄、 土、龟-脓肿、草、不产色、海-溃疡、金色、苏尔加、蟾赊、耻垢。
检测范
效:同时检测17种分枝杆菌(包括TB )
卜快 速:> 4周(菌种鉴定) 6小时
A灵敏:1CP个菌/反应
结核分枝杆菌耐药基因检测试剂盒
基于rpoB (利福平)和katG/inhA (异烟駢)的基因突变,对
耐多药结核病做出快速诊断。
卜通量:两个一线抗结核药(MDR)
?速度:8周(药敏) 6小时
>灵敏度:10,个菌/反应
病毒性疾病的分子检测
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV )
?全世界有3.5亿慢性携带者,
75 %在亚太地区
?每年有一百万人死于HBV感染,
是全球范围内第9位死因
50%?70%的人受过感染,
75 %的长期慢性携带者来自亚太地区
中国:
8%?10%是HBV携带者
HBV的形态特征
二卜角花
二卜角花lucMhetiwlGTO iCJ-
小糸讪诙Vr
S^rdl urfir.? firoiw (SJ 牛血或白
—c.rtiefii ^rrnfiir (“Pro 码
?.*穴.向埶 a _flw y Mgr ortart
fJU FH-^ + PiaBil
口最常见的血清型为adw、adr和ayw □亚型的地区分布不同,我国以adr为主, adw次之,而ayw见于新疆、西藏和内 蒙古等地
□Na
Hepatiiis Bvirus
乙肝表面
脂层(来自 宿主细胞)乙肝核心抗原
脂层(来自 宿主细胞)
乙肝核心抗原
CQCCQ J^mos A.七伽$
DNA病毒 二生(非环状)
DNA不等长
口正链(2/3) 口负链
HBV基因组结构
Region X: 泌
基因重叠
编码
zpre-Sl —
S区 pre-S2 —
pre-C
pre-Sl蛋白 pre-S2蛋白 HBsAg HBeAg HBcAg
DNAP
HBxAg
HBsAg
pre-S2
pre-Sl
急性感染时期HBV
急性感染时期HBV的
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