基于云计算的传染病症候群与病原学监测数据分析平台设计与实现.docxVIP

基于云计算的传染病症候群与病原学监测数据分析平台设计与实现 从“传染性非典型肺炎”到甲型H1N1流感，再到新型冠状病毒肺炎暴发，都迫切需要一个灵活的应急机制和敏感的信息系统，而我国大多数的疾病监测系统只针对事件发生后的报告。不同于“以诊断为基础”或“以疾病为基础”的公共卫生监测，症候监测是“以综合征为基础”，致力于早期发现突发公共卫生事件的主动监测，更注重监测的及时性和敏感性，目前正日益受到世界各国的重视 “十一五”和“十二五”期间，依托传染病防治国家科技重大专项“传染病监测技术平台”项目（以下简称“项目”），我国已建立了覆盖不同地区的传染病监测实验室网络，开展了覆盖法定报告传染病和其他多种非法定传染病以及新发、突发传染病的病原学研究，为我国传染病疫情防控提供了科技支撑和技术服务1 应用现状传染病监测技术平台信息管理系统在应用过程中也暴露出一些问题。首先，存在一定的信息泄露安全隐患。在系统设计上，数据报送基于互联网实施，用户采用“用户名+口令”的弱认证登录方式，密码复杂度要求较低，面临网络恶意攻击等诸多威胁。在用户管理上，用户类型复杂，每家机构对数据填报人员的管理标准高低不一，人员安全意识不均衡，存在多个用户使用同一登录账号情况，尚未建立行之有效的用户管理模式。其次，系统已不能适应新的信息管理需求。系统已平稳运行多年，积累了大量监测业务数据，迫切需要利用新兴信息技术深入挖掘分析，有效地将业务采集数据转化为有价值的结果，辅助实现数据报送、共享利用与分析决策有机结合的信息流程，为升级我国现有基于单病种的传染病监测模式，实现传染病多病原综合监测探索技术路径。2 业务需求2.1 统一用户认证与权限管理将传染病症候群与病原学监测网络信息云平台作为唯一访问入口，采用虚拟专用网络（virtual private network，VPN）接入，数字认证（digital?certificate，CA）方式登录，根据登录用户权限判断并显示用户能够访问的业务系统。平台涉及的所有应用系统用户、权限统一由用户认证与权限系统进行维护和管理。用户权限管理实行用户分级管理的原则，级别划分为国家级、省级、地市级、县区级。本级业务管理用户必须由上级系统管理员先为其分配业务权限和功能权限。2.2 五大症候群传染病监测完善发热呼吸道症候群、腹泻症候群、发热伴出血症候群、发热伴出疹症候群、脑炎脑膜炎症候群信息录入模块，并修订相应病原的统计结果。添加病例输入项包括患者编号、患者姓名、性别、出生日期、所在地、患者职业、病历号、所属症候群、病例类型、发病日期、就诊日期、数据来源等信息。查询病例查询条件输入项包括患者编号、患者姓名、病历号、所属症候群、病例类型、发病日期、就诊日期。2.3传染病症候群与病原学监测数据综合分析依据相关规则，对采集得到的五大症候群监测数据进行数据质量分析、清洗，变量归类、去重，分析产出业务统计分析指标。借助SPSS、SAS、R、ArcGis等统计分析软件，对数据基本特征、病原谱、病原体检出率、症状发生率、病原体复合感染及相互关系、病原体感染影响因素等相关统计指标，通过统计表、统计图（地图、柱状图、饼图、热力图、韦恩图等）进行不同维度的分析和展示。2.4 病原组学信息共享将研究产生的自然疫源流感病毒基因组数据，构建形成病原组学信息数据库，包括病毒宿主、病毒亚型、采样时间、采样地点等信息。由此建立病原组学信息共享平台，通过对汇集数据的清洗、转化，提供病原组学信息管理功能。结合基本统计图表、地图等方式，提供采集时间、宿主类型、病毒亚型占比等维度的统计分析与信息共享。3 平台设计3.1 设计目标基于云计算技术，安全加固和优化完善传染病监测技术平台信息管理系统，利用已建的电子认证云服务平台，实现系统授权用户身份云认证，强化系统用户管理。通过构建具有症候群与病原监测信息采集、挖掘分析、资源共享功能的传染病症候群与病原学监测网络信息云平台，实现已建设的传染病监测技术平台信息管理系统，新建设的传染病症候群与病原学监测综合分析平台、病原组学信息共享平台的统一集成与云部署应用，提供可视化统计分析结果展示，为传染病多病原的综合监测提供科技支撑。3.2 架构设计3.2.1 总体架构遵循的“统一数据采集、业务应用共享”的建设思路和总体架构，在已建传染病监测技术平台信息管理系统架构的基础上规划设计、动态扩充，总体架构设计如图1所示。①基础设施层。由网络系统、云服务器系统、云存储系统、安全系统及基础软件构成，为业务应用提供底层的运行环境。②数据支撑层。将系统涉及的各类数据源进行统一访问封装、统一管理、统一存储，形成病例信息库、样本信息库、菌毒株信息库、病原组学信息库、统计分析库等。服务于系统内和不同系统间纵向与横向的数据